顔研究業績

 

 

「原著論文」

 

（2024年）

 

23-1) Sazki-Hagenbach, P., Kleeblatt, E., Fukuda, M., Ali, H. and Sagi-Eisenberg, R. (2024) The underlying Rab network of MRGPRX2-stimulated secretion unveils the impact of receptor trafficking on secretory granule biogenesis and secretion. Cells 13, 93 [PubMed]

 

24-2) Nakamura, H. and Fukuda, M. (2024) Establishment of a synchronized tyrosinase transport system revealed a role of Tyrp1 in efficient melanogenesis by promoting tyrosinase targeting to melanosomes. Sci. Rep. 14, 2529 [PubMed]（メラニン合成・チロシナーゼはメラノソームとは別個に合成され、後から未成熟メラノソームへと輸送されます。チロシナーゼは定常状態でゴルジ体やエンドソームなど複数のオルガネラに局在するため、チロシナーゼ輸送の解析の障害となっていました。今回私達は、FM4という自己オリゴマー化ドメインを用いて、チロシナーゼの同調輸送系を確立しました。このシステムを用いて、Tyrp1が効率的なチロシナーゼの輸送に関与することを突き止めました。）

 

（2023年）

 

23-1) Shikanai, M., Ito, S., Nishimura, Y., Akagawa, R., Fukuda, M., Yuzaki, M., Nabeshima, Y. and Kawauchi, T. (2023) Rab21 regulates caveolin-1-mediated endocytic trafficking to promote immature neurite pruning. EMBO Rep. 24, e51475 [PubMed]

 

23-2) Nakashima, S., Matsui, T. and Fukuda, M. (2023) Vps9d1 regulates tubular endosome formation through specific activation of Rab22A. J. Cell Sci. 136, jcs260522 [PubMed]（管状エンドソームは、クラスリン非依存性エンドサイトーシス（CIE）によって取り込まれた物質のリサイクルに関与しており、その管状構造の形成にはRab22Aが重要であることを私達は以前に見出しています。しかし、Rab22Aがどのような機構で活性化され、CIEカーゴのリサイクルを制御するのかはこれまで全く分かっていませんでした。今回私達は、ゲノム上に存在するRab活性化因子（GEF）の候補を網羅的にスクリーニングすることにより、機能未知のVps9d1という分子を同定することに成功しました。また、Vps9d1はin vitroでRab22Aを活性化し、その欠損により管状エンドソームの形成が著しく損なわれることを見出しました。）

 

23-3) Ishiyama, S., Hasegawa, T., Sugeno, N., Kobayashi, J., Yoshida, S., Miki, Y., Wakabayashi, K., Fukuda, M., Kawata, Y., Nakamura, T., Sato, K., Ezura, M., Kikuchi, A., Takeda, A. and Aoki, M. (2023) Sortilin acts as an endocytic receptor for α-synuclein fibril. FASEB J. 37, e23017 [PubMed]

 

23-4) Komori, T., Kuwahara, T., Fujimoto, T., Sakurai, M., Koyama-Honda, I., Fukuda, M. and Iwatsubo, T. (2023) Phosphorylation of Rab29 at Ser185 regulates its localization and role in the lysosomal stress response in concert with LRRK2. J. Cell Sci. 136, jcs.261003 [PubMed]

 

23-5) Brauer, N., Maruta, Y., Strege, K., Oschlies, I., Nakamura, H., Lisci, M., Böhm, S., Lehmberg, K., Brandhoff, L., Hennies, H. C., Ehl, S. R. Parvaneh, N., Kappler, W., Fukuda, M., Griffiths, G. M., Niehues, T. and Ammann, S. K. (2023) Immunodeficiency with susceptibility to lymphoma with complex genotype affecting energy metabolism (FBP1, ACAD9) and vesicle trafficking (RAB27A). Front. Immunol. 14, 1151166 [PubMed]（Rab27Aに変異を持つ免疫不全症の機能解析をドイツ、イギリス、イラン、日本の４カ国の国際共同研究で行いました！）

 

23-6) Noda, K., Lu, S.-L., Chen, S., Tokuda, K., Li, Y., Hao, F., Wada, Y., Sun-Wada, G.-H., Murakami, S., Fukuda, M., Itoh, T. and Noda, T. (2023) Characterization of Rab32- and Rab38-positive lysosome-related organelles in osteoclasts and macrophages. J. Biol. Chem. 299, 105191 [PubMed]

 

23-7) Matsui, T., Sakamaki, Y., Hiragi, S. and Fukuda, M. (2023) VAMP5 and distinct sets of cognate Q-SNAREs mediate exosome release. Cell Struct. Funct. 48, 187–198 [PubMed]（極性化した上皮細胞の頂端膜側と側底膜側からは、形成・輸送機構の異なる二種類のエクソソームが分泌されています（EMBO Rep., 2021; Cell Rep., 2022）。今回私達は、エクソソームの元となる内腔小胞を含む多胞体と細胞膜の融合機構に焦点を当て、頂端膜側と側底膜側では異なる組み合わせのSNARE複合体が機能することを突き止めました。すなわち、頂端膜側ではVAMP5-SNAP47-STX1のみが機能し、側底膜側ではVAMP5-SNAP47-STX1に加えてVAMP5-SNAP47-STX4が特異的に機能することを初めて明らかにしました。）

 

23-8) Tokuda, K., Lu, S.-L., Zhang, Z., Kato, Y., Chen, S., Noda, K., Hirose, K., Usami, Y., Uzawa, N., Murakami, S., Toyosawa, S., Fukuda, M., Sun-Wada, G.-H., Wada, Y. and Noda T. (2023) Rab32 and Rab38 maintain bone homeostasis by regulating intracellular traffic in osteoclasts. Cell Struct. Funct., 48, 223–239 [PubMed]

 

23-9) Rios, J. J., Li, Y., Paria, N., Bohlender, R. J., Huff, C., Rosenfeld, J. A., Liu, P., Bi, W., Haga, K., Fukuda, M., Vashisth, S., Kaur, K., Chahrour, M., Bober, M. B., Duker, A. L., Ladha, F. A., Hanchard, N. A., Atala, K., Khanshour, A. M., Smith, L., Wise, C. A. and Delgado, M. R. (2023) RAB1A haploinsufficiency phenocopies the 2p14-p15 microdeletion and is associated with impaired neuronal differentiation. Am. J. Hum. Genet. 110, 2103-2111 [PubMed]

 

（2022年）

 

22-1) Oguchi, M. E., Homma, Y. and Fukuda, M. (2022) The N-terminal Leu-Pro-Gln sequence of Rab34 is required for ciliogenesis in hTERT-RPE1 cells. Small GTPases 13, 77-83 [PubMed]（私達は以前、一次繊毛（シリア）形成に重要な因子の一つとしてRab34を同定し、そのユニークなアミノ末端領域がシリア形成に関与することを報告しています（J. Biol. Chem., 2020）。今回私達は、Rab34のアミノ末端領域の詳細な機能解析を行い、進化的に保存された16-18番目の三つのアミノ酸（Leu-Pro-Gln）がシリア形成に重要であることを突き止めました。）

 

22-2) Matsui, T., Sakamaki, Y., Nakashima, S. and Fukuda, M. (2022) Rab39 and its effector UACA regulate basolateral exosome release from polarized epithelial cells. Cell Rep. 39, 110875 [PubMed]（極性化した上皮細胞の頂端膜側と側底膜側からは蛋白質組成の異なる二種類のエクソソームが分泌されており、その形成機構が全く異なることを以前に報告しています（EMBO Rep., 2021）。今回私達は、エクソソームの元となる内腔小胞を含む多胞体の細胞膜への輸送にも異なるセットのRab分子が関与することを突き止めました。すなわち、頂端膜エクソソームの分泌はRab27とRab37によって、側底膜エクソソームの分泌はRab39–UACA-BORCによって制御されることを初めて明らかにしました。また、パーキンソン病の原因となるRab39Bのミスセンス変異でもエクソソームの分泌能の低下が観察され、疾患発症との関連性も示唆されました。）［リンク］

 

22-3) Naß, J., Koerdt, S. N., Biesemann, A., Chehab, T., Yasuda, T., Fukuda, M., Martín-Belmonte, F. and Gerke, V. (2022) Tip-end fusion of a rod-shaped secretory organelle. Cell. Mol. Life Sci. 79, 344 [PubMed]

 

22-4) Hiragi, S., Matsui, T., Sakamaki, Y. and Fukuda, M. (2022) TBC1D18 is a Rab5-GAP that coordinates endosome maturation together with Mon1. J. Cell Biol. 221, e202201114 [PubMed]（エンドサイトーシスによって細胞内に取り込まれた物質は、初期エンドソーム、後期エンドソームを経て最終的にリソソームで分解を受ける。このエンドソーム成熟過程には、Rab5からRab7への遷移が不可欠と考えられているが、Rab5がいつどこで、どのような機構で不活性化されるかはこれまで明らかではなかった。今回、エンドソーム成熟を制御する新規Rab5の不活性化因子としてTBC1D18を同定することに成功し、Rab5不活性化の重要性を含めたエンドソーム成熟に関する新たなモデルを提唱しました。）［リンク］

 

22-5) Maruta, Y. and Fukuda, M. (2022) Large Rab GTPase Rab44 regulates microtubule-dependent retrograde melanosome transport in melanocytes. J. Biol. Chem. 298, 102508 [PubMed]（メラノサイトにおけるメラノソームの分布は細胞骨格上の順行性輸送と逆行性輸送のバランスによって制御されています。私達はこれまで逆行性輸送モーター（ダイニン）のメラノソーム上のレセプターとして、メラノレギュリンとRab36を同定していますが、両者を欠損させても逆行性輸送は完全には止まらないことから、第三の因子の存在が示唆されていました。今回、メラノソームの逆行性輸送を制御する最後の因子としてlarge Rabの一種、Rab44を同定することに成功し、カルシウムイオンによる制御やその輸送機構を解明しました。）

 

22-6) Nishizawa, A., Maruta, Y. and Fukuda, M. (2022) Rab32/38-dependent and -independent transport of tyrosinase to melanosomes in B16-F1 melanoma cells. Int. J. Mol. Sci. 23, 14144 [PubMed]（培養メラノサイトは、メラニン産性能を保持したまま長期培養が困難なため、現在主流となっているCRISPR/Cas9によるノックアウト（KO）解析には不向きです。一方、メラノーマは無限増殖が可能なため、KO株の樹立は可能ですが、メラノサイトとメラノーマでメラノソームの形成・輸送が同じメカニズムで行われているかはこれまで明らかではありませんでした。今回、B16-F1メラノーマ細胞を用いたKO解析を行い、メラニン合成やメラノソームの輸送の仕組みはB16-F1細胞でも保たれていましたが、メラニン合成酵素のメラノソームへの輸送の仕組みはメラノサイトとは異なることが明らかになりました。メラノサイトでは、BLOC-3・Rab32/38・Varpの経路がメラニン合成酵素の輸送に重要ですが、B16-F1細胞にはこの経路とは非依存的なものが存在することを初めて突き止めました。メラノーマ細胞はその取り扱いやすさから、美白研究などで良く用いられていますが、今回の成果により、メラニン合成酵素の輸送を対象とした解析を行う際には、注意を要することが明らかになりました。）

 

（2021年）

 

21-1) Urrutia, P. J., Bodaleo, F., Bórquez, D. A., Homma, Y., Rozes-Salvador, V., Villablanca, C., Conde, C., Fukuda, M. and González-Billault, C. (2021) Tuba activates Cdc42 during neuronal polarization downstream of the small GTPase Rab8a. J. Neurosci. 41, 1636-1649 [PubMed]

 

21-2) Matsui, T., Osaki, F., Hiragi, S., Sakamaki, Y. and Fukuda, M. (2021) ALIX and ceramide differentially control polarized small extracellular vesicle release from epithelial cells. EMBO Rep. 22, e51475 [PubMed]（エクソソームは粒径100 nm前後の細胞外小胞の一種で、近年新たな細胞間コミュニケーションの手段として注目されています。最近、サイズや組成の異なるエクソソームの存在が報告されるようになってきましたが、その『異質性（多様性）』を生み出す仕組みは明らかではありませんでした。本研究では、二種類の異なる細胞膜（頂端膜と側底膜）を持つMDCK細胞を用いて、異なる細胞膜から放出される組成の異なるエクソソームの形成機構の違いを解明しました。すなわち、頂端膜側のエクソソームの形成にはALIX-Syntenin1–Syndecan1複合体が、側底膜側のエクソソームの形成にはスフィンゴミエリナーゼ（nSMase2）依存的なセラミド代謝が独立に機能することを初めて突き止めました。）［リンク］

 

21-3) Osaki, F., Matsui, T., Hiragi, S., Homma, Y. and Fukuda, M. (2021) RBD11, a bioengineered Rab11-binding module for visualizing and analyzing endogenous Rab11. J. Cell Sci. 134, jcs257311 [PubMed]（Rabの機能解析を行う手法の一つとして、Rabエフェクタードメインの過剰発現が知られていますが、多くのエフェクタードメインは複数のRabと結合してしまうため、特異性が低いという問題点がありました。今回私達は、バイオエンジニアリングを用いて活性型のRab11のみに結合する新規ツールとして、『RBD11』を開発することに成功しました。RBD11（あるいはRBD11をタンデムにつないだ2×RBD11）を細胞に発現することにより、細胞が生きたままの状態で内在性のRab11の局在を可視化したり、Rab11の機能を阻害することが可能になりました。）

 

21-4) Homma, Y. and Fukuda, M. (2021) Knockout analysis of Rab6 effector proteins revealed the role of VPS52 in the secretory pathway. Biochem. Biphys. Res. Common. 561, 151-157 [PubMed]（Rab6-KO細胞では可溶性蛋白質の分泌阻害（リソソームでの蓄積）や基底膜の形成不全の症状が観察されますが、Rab6がどのような機構で分泌経路を制御しているのかは未だ明らかになっていません。今回私達は、6種類のRab6エクフェクター候補分子のKO細胞株を樹立し、その表現型の解析を行いました。その結果、VPS52-KO細胞のみが可溶性蛋白質の分泌阻害の症状を示しましたが、全てのKO細胞で基底膜が正常に形成されていました。このことから、Rab6は分泌経路と基底膜形成において異なるエフェクター分子を使い分けており、基底膜形成に関しては未知のエフェクター分子の関与が示唆されます。）

 

21-5) Omar, J., Rosenbaum, E., Efergan, A., Abu Sneineh, B., Yeheskel, A., Maruta, Y. Fukuda, M. and Sagi-Eisenberg, R. (2021) Biochemical and structural insights into Rab12 interactions with RILP and its family members. Sci. Rep. 11, 10317 [PubMed]

 

21-6) Ganga, A. K., Kennedy, M. C., Oguchi, M. E., Gray, S. D., Oliver, K. E., Knight, T. A., De La Cruz, E. M., Homma, Y., Fukuda, M. and Breslow, D. K. (2021) Rab34 GTPase mediates ciliary membrane formation in the intracellular ciliogenesis pathway. Curr. Biol. 31, 2895-2905 [PubMed]

 

21-7) Komaki, K., Takano, T., Sato, Y., Asada, A., Ikeda, S., Yamada, K., Wei, R., Huo, A., Fukuchi, A., Saito, T., Ando, K., Murayama, S., Araki, W., Kametani, F., Hasegawa, M., Iwatsubo, T., Tomomura, M., Fukuda, M., Hisanaga, S.-I. (2021) Lemur tail kinase 1 (LMTK1) regulates the endosomal localization of β-secretase BACE1. J. Biochem. 170, 729–738 [PubMed]

 

21-8) Trofimenko, E., Homma, Y., Fukuda, M. and Widmann, C. (2021) The endocytic pathway taken by cationic substances requires Rab14 but not Rab5 and Rab7. Cell Rep. 37, 109945 [PubMed]

 

21-9) Hatoyama, Y., Homma, Y., Hiragi, S. and Fukuda, M. (2021) Establishment and analysis of conditional Rab1- and Rab5-knockout cells using the auxin-inducible degron system. J. Cell Sci. 134, jcs259184 [PubMed]（哺乳動物に共通して存在する58種類のRabのうち、Rab1とRab5は生存や増殖に必須のため、これまでノックアウト（KO）細胞株を樹立することができませんでした。今回、オーキシンデグロン法を用いてRab1とRab5の条件付きKO細胞株の作製に初めて成功しました。KO細胞の解析の結果、Rab1が初期エンドソームの細胞膜方向への輸送に、Rab5が初期・後期エンドソームの形成に重要な役割を果たすことが明らかになりました。本ツールの開発により、Rab1やRab5のより詳細な機能解明が可能になるものと期待されます。）（Research Highlightに選定）

 

（2020年）

 

20-1) Dolce, L. G., Ohbayashi, N., da Silva, D. F. C., Ferrari, A. J. R., Pirolla, R. A. S., Schwarzer, A. C. de A. P., Zanphorlin, L. M., Cabral, L., Fioramonte, M., Ramos, C. H. I., Gozzo, F. C., Fukuda, M., de Giuseppe P. O. and Murakami, M. T. (2020) Unveiling the interaction between the molecular motor Myosin Vc and the small GTPase Rab3A. J. Proteomics 212, 103549 [PubMed]

 

20-2) Kabayama, H., Takeuchi, M., Tokushige, N., Muramatsu, S. I., Kabayama, M., Fukuda, M., Yamada, Y. and Mikoshiba, K. (2020) An ultra-stable cytoplasmic antibody engineered for in vivo applications. Nat. Commun. 11, 336 [PubMed]［リンク］

 

20-3) Ono, S., Otomo, A., Murakoshi S., Mitsui, S., Sato, K., Fukuda, M. and Hadano, S. (2020) ALS2, the small GTPase Rab17-interacting protein, regulates maturation and sorting of Rab17-associated endosomes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 523, 908-915 [PubMed]

 

20-4) Kinoshita, R., Homma, Y. and Fukuda, M. (2020) Rab35–GEFs, DENND1A and folliculin differentially regulate podocalyxin trafficking in two- and three-dimensional epithelial cell cultures. J. Biol. Chem. 295, 3652-3663 [PubMed]（私達は以前、２次元と３次元で培養した上皮細胞株（MDCK II細胞）において、Rab35が異なるエフェクター分子と結合することにより、頂端膜シグナル分子・podocalyxinの輸送を制御することを明らかにしています（JCB, 2016）。２次元培養では通常のdish上に、３次元培養では細胞外マトリックスのゲル中で上皮細胞様の組織を形成させますが、外環境の違いがRab35の活性化に与える影響はこれまで全く明らかではありませんでした。今回私達は、Rab35の上流活性化因子の探索を行い、２次元培養ではfolliculin、３次元培養ではDENND1Aという異なるRab35–GEFが機能することを突き止めました。）

 

20-5) Marubashi, S. and Fukuda, M. (2020) Rab7B/42 is functionally involved in protein degradation on melanosomes in keratinocytes. Cell Struct. Funct. 45, 45-55 [PubMed]［リンク］［2020 CSF Award］（メラノサイトで形成されたメラニン色素を含むメラノソームは最終的にケラチノサイトへと受け渡され、肌や髪の毛へと沈着しますが、ケラチノサイトに受け渡されたメラノソームがその後どのような運命を辿るかは良く分かっていませんでした。今回私達は、EGFP-Rab1～45を用いた網羅的な局在スクリーニングにより、ケラチノサイト内に取り込まれたメラノソームは、通常の低pHのリソソームではなく、LAMP1陽性、Rab7B陽性の未知の画分に存在するすることを明らかにしました。また、M－INK（JB, 2017）を応用したメラノソーム上の蛋白質の新規分解評価系を構築することにより、メラニン合成酵素のチロシナーゼなどがこの画分でRab7B依存的に分解されていることを突き止めました。今後、Rab7Bによるメラノソームの蛋白質の詳細な分解機構が明らかになれば、ケラチノサイト内でのメラニン代謝の人為的制御に応用されることも期待されます。）

 

20-6) Wei, R., Sugiyama, A., Sato, Y., Nozumi, M., Nishino, H., Takahashi, M., Saito, T., Ando, K., Fukuda, M., Tomomura, M., Igarashi, M. and Hisanaga, S.-I. (2020) Isoform-dependent subcellular localization of LMTK1A and LMTK1B and their roles in axon outgrowth and spine formation. J. Bichoem. 168, 23-32 [PubMed] (表紙に採用されました！)

 

20-7) Murata, T., Unno, Y. Fukuda, M. and Utsunomiya-Tate, N. (2020) The dynamic structure of Rab35 is stabilized in the presence of GTP under physiological conditions. Biochem. Biophys. Rep. 23, 100776 [PubMed]

 

20-8) Oguchi, M. E., Okuyama, K., Homma, Y. and Fukuda, M. (2020) A comprehensive analysis of Rab GTPases reveals a role for Rab34 in serum starvation-induced primary ciliogenesis. J. Biol. Chem. 295, 12674-12685 [PubMed] （一次繊毛（シリア）は外界からの刺激に対するセンサーとして働き、様々なシグナル受容に重要な役割を果たしています。シリアの形成にはダイナミックな膜動態が伴うため、膜輸送の制御因子である低分子量G蛋白質Rabの関与が示唆されていますが、Rabによるシリア形成制御の詳細な分子基盤は未だ明らかになっていません。今回私達は、ヒト網膜色素上皮細胞由来のhTERT-RPE1細胞を用いて、シリア形成に必須なRabの網羅的なノックダウン（ノックアウト）スクリーニングを行いました。その結果、飢餓誘導性のシリア形成にはこれまでに関与が示唆されていたRab8/10/11などではなく、Rab34が必須であることを見出しました。）

 

20-9) Mizushima, T., Jiang, G., Kawahara, T., Li, P., Han, B., Inoue, S., Ide, H., Kato, I., Jalalizadeh, M., Miyagi, E., Fukuda, M., Reis, L. O. and Miyamoto, H. (2020) Androgen receptor signaling reduces the efficacy of Bacillus Calmette-Guérin therapy for bladder cancer via modulating Rab27b-induced exocytosis. Mol. Cancer Ther. 19, 1930-1942 [PubMed]

 

20-10) Kuwahara, T., Kai, F., Komori, T., Sakurai, M., Yoshii, G., Eguchi, T., Fukuda, M. and Iwatsubo, T. (2020) Roles of lysosomotropic agents on LRRK2 activation and Rab10 phosphorylation. Neurobiol. Dis. 145, 105081 [PubMed]

 

20-11) Bhat, S., Ljubojevic, N., Zhu, S., Fukuda, M., Echard, A. and Zurzolo C. (2020) Rab35 and its effectors promote formation of tunneling nanotubes in neuronal cells. Sci. Rep. 10, 16803 [PubMed]

 

20-12) Murakawa, T., Kiger, A. A., Sakamaki, Y., Fukuda, M. and Fujita, N. (2020) An autophagy-dependent tubular lysosomal network synchronizes degradative activity required for muscle remodeling. J. Cell Sci. 133, jcs248336 [PubMed]（東京工業大学に異動した藤田尚信博士との共同研究で、ショウジョウバエの筋肉の再構成時に出現するオートファジー依存性の管状リソソームの存在を明らかにしました。）［リンク］[2020 JCS Prize]

 

20-13) Ohishi, Y., Ammann, S., Ziaee, V., Strege, K., Groß, M., Amos, C. V., Shahrooei, M., Ashournia, P., Razaghian, An., Griffiths, G. M., Ehl, S., Fukuda, M. and Parvaneh, N. (2020) Griscelli syndrome type 2 sine albinism: unraveling differential RAB27A effector engagement. Front. Immunol. 11, 612977 [PubMed]（白皮症を伴わず、免疫疾患のみを示す２型グリセリ症候群の新しいRAB27Aの変異の解析を行いました。イラン、英国、ベルギーの４カ国の研究者による国際共同研究の成果です！）

 

20-14) Yoshikawa-Murakami, C., Mizutani, Y., Ryu, A., Naru, E., Teramura, T., Homma, Y. and Fukuda, M. (2020) A novel method for visualizing melanosome and melanin distribution in human skin tissues. Int. J. Mol. Sci. 21, E8514 [PubMed]（メラニン色素を認識するHA-M-INKの新規プローブを開発し、ヒトの皮膚組織の染色に応用しました。組織内におけるメラニンの三次元的分布を示すことに初めて成功しました。株式会社コーセーとの産学共同研究の成果です！）［リンク］（Top Downloaded Papers 2020に選定）

 

（2019年）

 

19-1) Morishita, S., Wada, N., Fukuda, M. and Nakamura, T. (2019) Rab5 activation on macropinosomes requires ALS2, and subsequent Rab5 inactivation through ALS2 detachment requires active Rab7. FEBS Lett. 593, 230-241 [PubMed]

 

19-2) Etoh, K. and Fukuda, M. (2019) Rab10 regulates tubular endosome formation through KIF13A and KIF13B motors. J. Cell Sci. 132, jcs226977 [PubMed]（First personで紹介）（管状エンドソームは近年発見されたリサイクリングエンドソームの一種で、細胞内に取り込まれた特定の分子（積荷）の選別に関与すると考えられています。しかし、管状エンドソームの形成機構やその詳細な機能については明らかになっていません。今回私達は、網羅的なRabの局在スクリーニングとノックアウト細胞株の解析を組み合わせることで、環状エンドソームの形成に必須の因子としてRab10を同定することに成功しました。また、Rab10は微小管モーターのKIF13A/Bと結合することにより、環状エンドソームの形成に関与することも明らかになりました。）（Highlighted Articleに選定）

 

19-3) Takahashi, T., Minami, S., Tsuchiya, Y., Tajima, K., Sakai, N., Suga, K., Hisanaga, S.-I., Ohbayashi, N., Fukuda, M. and Kawahara, H. (2019) Cytoplasmic control of Rab family small GTPases through BAG6. EMBO Rep. 20, e46794 [PubMed]

 

19-4) Ohishi, Y., Kinoshita, R., Marubashi, S., Ishida, M. and Fukuda, M. (2019) The BLOC-3 subunit HPS4 is required for activation of Rab32/38 GTPases in melanogenesis, but its Rab9 activity is dispensable for melanogenesis. J. Biol. Chem. 294, 6912-6922 [PubMed]（HPS4はBLOC-3複合体の構成因子で、その変異により白皮症の症状を示すヘルマンスキー・パドラック症候群を引き起こします。近年、HPS4がRab32/38の活性化因子として機能するだけでなく、Rab9のエフェクターとしても作用することが報告され、二つのRabがカスケードを構成する（Rab9に結合後、Rab32/38を活性化する）ことが示唆されていました。しかし、これらのRabの機能的な関係はこれまで解析されていませんでした。今回私達は、Rab32/38を活性化できない変異体やRab9と結合できない変異体を作製することにより、Rab32/38の活性化はメラニン形成に不可欠であるが、Rab9との結合は必須でないことをはじめて明らかにしました。）

 

19-5) Homma, Y., Kinoshita, R., Kuchitsu, Y., Wawro, P. S., Marubashi, S., Oguchi, M. E., Ishida, M., Fujita, N. and Fukuda, M. (2019) Comprehensive knockout analysis of the Rab family GTPases in epithelial cells. J. Cell Biol. 218, 2035-2050 [PubMed]（上皮細胞由来のMDCK細胞を用いて、CRISPR/Cas9のゲノム編集技術により、哺乳類に共通して存在する58種類全てのRabのノックアウト（KO）コレクションを世界で初めて作製しました！KO細胞の解析の結果、いずれのRabのKO細胞でも上皮細胞に特有の頂底極性は形成されますが、Rab6のKO細胞でのみ基底膜が形成されないことを見出しました。詳細な解析の結果、Rab6は可溶性蛋白質全般の分泌に重要ですが、膜蛋白質の細胞膜への輸送には必須ではないことが明らかになりました。可溶性蛋白質と膜蛋白質は同じ分泌経路によりゴルジ体から細胞膜まで輸送されるため、両者はゴルジ体で同じ輸送小胞に選別されると一般的に考えられています。しかし、今回の発見により、Rab6非存在下では膜蛋白質は可溶性蛋白質とは異なる仕組みで輸送されることが強く示唆され、その仕組みが明らかになれば教科書の記載変更にもつながるものと期待されます。）［リンク］

 

19-6) Inoue, J., Ninomiya, M., Umetsu, T., Nakamura, T., Kogure, T., Kakazu, E., Iwata, T., Takai, S., Sano, A., Fukuda, M., Watashi, K., Isogawa, M., Tanaka, Y., Shimosegawa, T., McNiven, M. A. and Masamune, A. (2019) Small interfering RNA screening for the small GTPase Rab proteins identifies that Rab5B as a major regulator of hepatitis B virus production. J. Virol. 93, e00621-19 [PubMed]

 

19-7) Furusawa, K., Takasugi, T., Chiu, Y.-W., Hori, Y., Tomita, T., Fukuda, M. and Hisanaga, S.-I. (2019) CD2-associated protein (CD2AP) overexpression accelerates amyloid precursor protein (APP) transfer from early endosomes to the lysosomal degradation pathway. J. Biol. Chem. 294, 10886-10899 [PubMed]

 

19-8) Kobayashi, J., Hasegawa, T., Sugeno, N., Yoshida, S., Akiyama, T., Fujimori, K., Hatakeyama, H., Miki, Y., Tomiyama, A., Kawata, Y., Fukuda, M., Kawahata, I., Yamakuni, T., Ezura, M., Kikuchi, A., Baba, T., Takeda, A., Kanzaki, M., Wakabayashi, K., Okano, H. and Aoki, M. (2019) Extracellular α-synuclein enters dopaminergic cells by modulating flotillin-1-assisted dopamine transporter endocytosis. FASEB J. 33, 10240-10256 [PubMed]

 

19-9) Wei, Z., Zhang, M., Li, C., Huang, W., Fan, Y., Guo, J., Khater, M., Fukuda, M., Dong, Z. Hu, G. and Wu, G. (2019) Specific TBC domain-containing proteins control the ER-Golgi-plasma membrane trafficking of GPCRs. Cell Rep. 28, 554-566 [PubMed]（F1000PrimeのRecommended paperとして選定）

 

19-10) Arango Duque, G., Jardim, A., Gagnon, É., Fukuda, M. and Descoteaux, A. (2019) The host cell secretory pathway mediates the export of Leishmania virulence factors out of the parasitophorous vacuole. PLoS Pathog. 15, e1007982 [PubMed]［リンク］

 

19-11) Nishino, H., Saito, T., Wei, R., Takano, T., Tsutsumi, K., Taniguchi, M., Ando, K., Tomomura, M., Fukuda, M. and Hisanaga, S.-I. (2019) The LMTK1–TBC1D9B–Rab11A cascade regulates dendritic spine formation via endosome trafficking. J. Neurosci. 39, 9491-9502 [PubMed]

 

（2018年）

 

18-1) Oguchi, M. E., Etoh, K. and Fukuda, M. (2018) Rab20, a novel Rab small GTPase that negatively regulates neurite outgrowth of PC12 cells. Neurosci. Lett. 662, 324-330 [PubMed]（神経回路網が形成される際には、神経突起が伸長したり、退縮したりすることが知られています。これまで当研究室では、神経突起伸長を促進する（正に制御する）低分子量Gタンパク質Rabの機能解析を行って来ましたが、負に制御するRabについてはほとんど報告がありませんでした。今回私達は、PC12細胞を用いて、神経突起伸長を負に制御するRabのノックダウンスクリーニングを行い、神経突起伸長を制御する新規RabとしてRab20を同定することに成功しました。）

 

18-2) Yoshida, S., Hasegawa, T., Suzuki, M., Sugeno, N., Kobayashi, J., Ueyama, M., Fukuda, M., Ido-Fujibayashi, A., Sekiguchi, K., Ezura, M., Kikuchi, A., Baba, T., Takeda, A., Mochizuki, H., Nagai, Y. and Aoki, M. (2018) Parkinson’s disease-linked DNAJC13 mutation aggravates alpha-synuclein-induced neurotoxicity through perturbation of endosomal trafficking. Hum. Mol. Genet. 27, 823-836 [PubMed]［リンク］（F1000PrimeのRecommended paperとして選定）

 

18-3) Kuchitsu, Y., Homma, Y., Fujita, N. and Fukuda, M. (2018) Rab7 knockout unveils regulated autolysosome maturation induced by glutamine starvation. J. Cell Sci. 131, jcs215442 [PubMed]（低分子量G蛋白質Rab7は後期エンドソームにおける膜輸送だけでなく、オートファゴソームとリソソームの融合過程にも関与すると考えられています。しかし、今回哺乳動物細胞でRab7のノックアウト（KO）株を樹立したところ、Rab7はオートファゴソームとリソソームの融合には必須ではなく、Rab7-KO株ではオートリソソームが蓄積していることが明らかになりました。また、蓄積していたオートリソソームが、グルタミン飢餓により消失するという興味深い現象も見出しました。すなわち、栄養飢餓による刺激はオートファゴソームの形成だけでなく、その成熟過程も促進することが初めて明らかになりました。）（Highlighted Articleに選定）

 

18-4) Ogawa, M., Matsuda, R., Takada, N., Tomokiyo, M., Yamamoto, S., Shizukuishi, S., Yamaji, T., Yoshikawa, Y., Yoshida, M., Tanida, I., Koike, M., Murai, M., Morita, H., Takeyama, H., Ryo, A., Guan, J.-L., Yamamoto, M., Inoue, J. I., Yanagawa, T., Fukuda, M., Kawabe, H. and Ohnishi, M. (2018) Molecular mechanisms of Streptococcus pneumoniae-targeted autophagy via pneumolysin, Golgi-resident Rab41, and Nedd4-1 mediated K63-linked ubiquitination. Cell. Microbiol. 20, e12846 [PubMed]

 

18-5) Kanemitsu-Fujita, A., Morishita, S., Kjaer, S., Fukuda, M., Schiavo, G. and Nakamura, T. (2018) Comparable affinity of RabGDIα for GTP- and GDP-bound forms of Rab7 supports a four-state transition model for Rab7 subcellular localization. bioRxiv 287516 [link]

 

18-6) Eguchi, T., Kuwahara, T., Sakurai, M., Komori, T., Fujimoto, T., Ito, G., Yoshimura, S.-I., Harada, A., Fukuda, M., Koike, M. and Iwatsubo, T. (2018) LRRK2 and its substrate Rab GTPases are sequentially targeted onto stressed lysosomes and maintain their homeostasis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 115, E9115-E9124 [PubMed]［リンク］

 

18-7) Zhu, S., Bhat, S., Syan, S., Kuchitsu, Y., Fukuda, M. and Zurzolo, C. (2018) Rab11a-Rab8a cascade regulate the formation of tunneling nanotubes through vesicle recycling. J. Cell Sci. 131, jcs215889 [PubMed]

 

18-8) Hatta, T., Iemura, S.I., Ohishi, T., Nakayama, H., Seimiya, H., Yasuda, T., Iizuka, K., Fukuda, M., Takeda, J., Natsume, T. and Horikawa, Y. (2018) Calpain-10 regulates actin dynamics by proteolysis of microtubule-associated protein 1B. Sci. Rep. 8, 16756 [PubMed]

 

（2017年）

 

17-1) Furusawa, K., Asada, A., Urrutia, P., Gonzalez-Billault, C., Fukuda, M. and Hisanaga, S. I. (2017) Cdk5 regulation of the GRAB-mediated Rab8-Rab11 cascade in axon outgrowth. J. Neurosci. 37, 790-806 [PubMed]

 

17-2) Fujita, N., Huang, W., Lin, T.-H., Groulx, J.-F., Jean, S., Nguyen, J., Kuchitsu, Y., Koyama-Honda, I., Mizushima, N., Fukuda, M. and Kiger, A. A. (2017) Genetic screen in Drosophila muscle identifies autophagy-mediated T-tubule remodeling and a Rab2 role in autophagy. eLife 6, e23367 [PubMed]（藤田尚信助教との共同研究で、ショウジョウバエの筋細胞が変態期にオートファジーにより大規模に作り替えられる現象を見出し、オートファゴソームとリソソームの融合を制御する新分子としてRab2を同定することに成功しました。）［リンク］

 

17-3) Ishida, M., Marubashi, S. and Fukuda, M. (2017) M-INK, a novel tool for visualizing melanosomes and melanocores. J. Biochem. 161, 323-326 [PubMed]（メラノサイトで形成されたメラノソーム（メラニン色素）は最終的にケラチノサイトへと受け渡され、肌や髪の毛へと沈着しますが、その受け渡しの分子機構は実はほとんど解明されていません。解明が遅れている最大の理由の一つとして、ケラチノサイトに受け渡されたメラノソームを適切に検出するツールが無いことが挙げられます。今回私達は、ケラチノサイトに受け渡されたメラノソームを効率良く検出する新規のツール・『M-INK』の開発に成功しました。今後、M-INKを駆使することにより、ケラチノサイトへのメラノソームの受け渡しの分子機構が解明されることが期待されます。）［リンク］

 

17-4) Aoki, Y., Manzano, R., Lee, Y., Dafinca, R., Aoki, M., Douglas, A. G. L., Varela, M. A., Sathyaprakash, C., Scaber, J., Barbagallo, P., Vader, P., Mäger, I., Ezzat, K., Turner, M. R., Ito, N., Gasco, S., Ohbayashi, N., El-Andaloussi, S., Takeda, S., Fukuda, M., Talbot, K. and Wood, M. J. A. (2017) C9orf72 and RAB7L1 regulate vesicle trafficking in amyotrophic lateral sclerosis and frontotemporal dementia. Brain 140, 887-897 [PubMed]（Editor’s choiceに選定）

 

17-5) Kabayama, H., Tokushige, N., Takeuchi, M., Kabayama, M., Fukuda, M. and Mikoshiba, K. (2017) Parkin promotes proteasomal degradation of synaptotagmin IV by accelerating polyubiquitination. Mol. Cell. Neurosci. 80, 89-99 [PubMed]

 

17-6) Oguchi, M. E., Noguchi, K. and Fukuda, M. (2017) TBC1D12 is a novel Rab11-binding protein that modulates neurite outgrowth of PC12 cells. PLoS One 12, e0174883 [PubMed]（リサイクリングエンドソームは細胞膜上の分子のリサイクルだけでなく、細胞質分裂、オートファジー、神経突起伸長などの生命現象において重要な役割を果たしています。リサイクリングエンドソームでの物質輸送には低分子量Gタンパク質Rab11などが関与しますが、その時空間的な制御は十分に解明されていません。今回私達は、Rabの不活性化因子と考えられている43種類のTBCタンパク質に着目し、リサイクエリングエンドソームで機能する新規TBCタンパク質の探索を行いました。その結果、TBC1D12がRab11と結合してリサイクリングエンドソームに局在し、Rab11依存的に神経突起伸長を制御することを明らかにしました。）

 

17-7) Takahama, M., Fukuda, M., Ohbayashi, N., Kozaki, T., Misawa, T., Okamoto, T., Matsuura, Y., Akira, S. and Saitoh, T. (2017) The RAB2B-GARIL5 complex promotes cytosolic DNA-induced innate immune responses. Cell Rep. 20, 2944-2954 [PubMed]

 

17-8) Klein, O., Roded, A., Zur, N., Azouz, N. P., Pasternak, O., Hirschberg, K., Hammel, I., Roche, P. A., Yatsu, A., Fukuda, M., Galli, S. J. and Sagi-Eisenberg, R. (2017) Rab5 is critical for SNAP23 regulated granule-granule fusion during compound exocytosis. Sci. Rep. 7, 15315 [PubMed]

 

17-9) Li, C., Wei, Z., Fan, Y., Huang, W., Su, Y., Li, H., Dong, Z., Fukuda, M., Khater, M. and Wu, G. (2017) The GTPase Rab43 controls the anterograde ER-Golgi trafficking and sorting of GPCRs. Cell Rep. 21, 1089-1101 [PubMed]

 

（2016年）

 

16-1) Hirano, S., Uemura, T., Annoh, H., Fujita, N., Waguri, S., Itoh, T. and Fukuda, M. (2016) Differing susceptibility to autophagic degradation activity of two LC3-binding proteins: SQSTM1/p62 and TBC1D25/OATL1. Autophagy 12, 312-326 [PubMed]（Rab33B不活性化因子・OATL1はLC3と結合することによりオートファゴソームにリクルートし、オートファゴソームとリソソームの融合過程を制御することが知られています。LC3はオートファゴソームの内膜と外膜の両方に局在するため、内側のLC3はオートファジーにより分解されます。LC3と結合するp62もオートファジーによる分解を受けますが、OATL1は何故かオートファジーの基質にはなりません。今回私達は、OATL1がオートファジーによる分解から回避する機構の解明に取り組み、OATL1はp62とは異なりオリゴマー化能を持たず、選択的にオートファゴソームの外膜に局在することを突き止めました。）

 

16-2) Marubashi, S., Shimada, H., Fukuda, M. and Ohbayashi, N. (2016) RUTBC1 functions as a GTPase-activating protein for Rab32/38 and regulates melanogenic enzyme trafficking in melanocytes. J. Biol. Chem. 291, 1427-1440 [PubMed]（メラニン合成酵素のメラノソームへの輸送にはRab32/38が必須の役割を果たしています。これまでの研究で、Rab32/38のエフェクター分子としてVarp、活性化因子（GEF）としてBLOC-3複合体（HPS1/4）が同定されていますが、メラノサイトで機能するRab32/38不活性化因子（GAP）の存在は明らかではありませんでした。今回私達は、RUTBC1というTBC蛋白質がメラノサイトにおいてRab32/38の不活性化因子として機能し、メラニン合成酵素の制御に関わることを突き止めました。尚、本研究は筑波大学に異動した大林典彦博士との共同研究です。）

 

16-3) Yasuda, S., Morishita, S., Fujita, A., Nanao, T., Wada, N., Waguri, S., Schiavo, G., Fukuda, M. and Nakamura, T. (2016) Mon1-Ccz1 activates Rab7 only on late endosomes and dissociates from the lysosome in mammalian cells. J. Cell Sci. 129, 329-340 [PubMed]（In this issueに選定）

 

16-4) Efergan, A., Azouz, N. P., Klein, O., Noguchi, K., Rothenberg, M. E., Fukuda, M. and Sagi-Eisenberg, R. (2016) Rab12 regulates retrograde transport of mast cell secretory granules by interacting with the RILP-dynein complex. J. Immunol. 196, 1091-1101 [PubMed]

 

16-5) Hashimoto, A., Oikawa, T., Hashimoto, S., Sugino, H., Yoshikawa, A., Otsuka, Y., Handa, H., Onodera, Y., Nam, J.-M., Oneyama, C., Okada, M., Fukuda, M. and Sabe, H. (2016) P53- and mevalonate pathway–driven malignancies require Arf6 for metastasis and drug resistance. J. Cell Biol. 213, 81-95 [PubMed]（In Focusに選定）

 

16-6) Mrozowska, P. S. and Fukuda, M. (2016) Regulation of podocalyxin trafficking by Rab small GTPases in 2D and 3D epithelial cell cultures. J. Cell Biol. 213, 355-369 [PubMed]（Spotlightに選定）（F1000PrimeのRecommended paperとして選定）（上皮細胞は隣り合った細胞や細胞外マトリックスと接する側底膜といずれとも接しない頂端膜を持ち、両者は密着結合により隔てられています。このため、それぞれの膜で働くタンパク質は極性輸送と呼ばれる特殊な輸送システムで目的地に運ばれる必要がありますが、その詳細な仕組みは良く分かっていません。今回私達は、MDCK II細胞を用いて、シグナル分子の一種であるpodocalyxinの頂端膜への輸送機構を詳細に解析し、２次元と３次元（シスト）で培養した上皮細胞では異なるセットのRabやエフェクター分子がpodocalyxinの輸送を制御することを見出しました。）

 

16-7) Marubashi, S., Ohbayashi, N. and Fukuda, M. (2016) A Varp-binding protein, RACK1, regulates dendrite outgrowth through stabilization of Varp protein in mouse melanocytes. J. Invest. Dermatol. 136, 1672-1680 [PubMed]（Varp分子は４種類のRab（Rab21, Rab32/38, Rab40C）の制御因子として機能し、メラノサイトにおいて樹状突起の形成やメラニン合成酵素の輸送に関与することがこれまでに明らかになっています。今回私達は、Varp分子の新たなANRK2結合因子としてRACK1を見出しました。RACK1はRab40Cと競合することによりVarp分子の安定化に寄与するため、RACK1ノックダウン細胞ではVarp分子が減少し、結果的に樹状突起の伸長やメラニン合成酵素の輸送が阻害されることが明らかになりました。）

 

16-8) Wankel, B., Ouyang, J., Guo, X., Hadjiolova, K., Miller, J., Liao, Y., Tham, D. K. L., Romih, R., Andrade, L. R., Gumper, I., Simon, J.-P., Sachdeva, R., Tolmachova, T., Seabra, M. C., Fukuda, M., Schaeren-Wiemers, N., Hong, W. J., Sabatini, D. D., Wu, X.-R., Kong, X., Kreibich, G., Rindler, M. J. and Sun T.-T. (2016) Sequential and compartmentalized action of Rabs, SNAREs, and MAL in the apical delivery of fusiform vesicles in urothelial umbrella cells. Mol. Biol. Cell 27, 1621-1634 [PubMed]

 

16-9) Homma, Y. and Fukuda, M. (2016) Rabin8 regulates neurite outgrowth in both GEF-activity-dependent and -independent manners. Mol. Biol. Cell 27, 2107-2118 [PubMed]（A Highlights from MBoC Selectionに選定）（神経突起を伸長する際には、核近傍のリサイクリングエンドソームから突起方向への膜輸送が重要であり、この過程にはRab8, Rab11, Rab35などの低分子量Gタンパク質の関与が明らかになっています。これらのRabは神経成長因子依存的に活性化され、リサイクリングエンドソームに局在すると考えられていますが、その分子機構はこれまで明らかではありませんでした。今回私達は、Rab8の上流活性化因子（GEF）として知られるRabin8の機能解析を行い、この分子がリサイクリングエンドソームにおいてRab8だけでなくRab10の活性化を介して神経突起の伸長を促進するだけで無く、Rab11依存的にGEF活性とは無関係に神経突起伸長を制御することを明らかにしました。）

 

16-10) Mankouri, J., Walter, C., Stewart, H., Bentham, M. J., Park, W. S., Heo, W. D., Fukuda, M., Griffin, S. and Harris, M. (2016) Release of infectious hepatitis C virus from Huh7 cells occurs via a trans-Golgi network to endosome pathway independent of very-low-density lipoprotein secretion. J. Virol. 90, 7159-7170 [PubMed]

 

16-11) Villarroel-Campos, D., Henriquez, D. R., Bodaleo, F. J., Oguchi, M. E., Bronfman, F. C., Fukuda, M. and Gonzalez-Billault, C. (2016) Rab35 functions in axon elongation are regulated by p53-related protein kinase (PRPK) in a mechanism that involves Rab35 protein degradation and the microtubule-associated protein 1B. J. Neurosci. 36, 7298-7313 [PubMed]

 

16-12) Bello, O. D., Cappa A. I., de Paola M., Zanetti, M. N., Fukuda, M., Fissore, R. A., Mayorga, L. S. and Michaut, M. A. (2016) Rab3A, a possible marker of cortical granules, participates in cortical granule exocytosis in mouse eggs. Exp. Cell Res. 347, 42-51 [PubMed]

 

16-13) Makino, A., Hullin-Matsuda, F., Murate, M., Abe, M., Tomishige, N., Fukuda, M., Yamashita, S., Fujimoto, T., Vidal, H., Lagarde, M., Delton-Vandenbroucke, I. and Kobayashi, T. (2016) Acute accumulation of free cholesterol induces the degradation of perilipin 2 and Rab18-dependent fusion of ER and lipid droplets in cultured human hepatocytes. Mol. Biol. Cell 27, 3293-3304 [PubMed]

 

（2015年）

 

15-1) Yatsu, A., Shimada, H., Ohbayashi, N. and Fukuda, M. (2015) Rab40C is a novel Varp-binding protein that promotes proteasomal degradation of Varp in melanocytes. Biol. Open 4, 267-275 [PubMed]（Varp分子はN末端側のVPS9ドメインを介してRab21を活性化することによりメラノサイトの樹状突起の形成を促進し、中央のANKR1ドメインを介してRab32/38を結合することによりメラニン合成酵素の輸送に関与することが知られていますが、C末端側に位置するANKR2ドメインの機能はこれまで明らかではありませんでした。今回私達はANKR2ドメインにRab40Cが特異的に結合することを見出しました。Rab40Cは他の一般的なRabとは異なり、SOCSボックスと呼ばれるユビキチンリガーゼをリクルートする領域を持ち、Varp分子をプロテアソーム依存的に分解することが明らかとなりました。このため、Rab40Cを過剰に発現するメラノサイトでは、Varp分子の分解が亢進し、メラニン合成酵素の輸送が阻害されることを突き止めました。）［リンク］

 

15-2) Ishida, M., Ohbayashi, N. and Fukuda, M. (2015) Rab1A regulates anterograde melanosome transport by recruiting kinesin-1 to melanosomes through interaction with SKIP. Sci. Rep. 5, 8238 [PubMed]（メラニン色素を含む成熟メラノソームは微小管とアクチン線維に沿って細胞膜周辺まで輸送されますが、微小管上の順行性輸送の仕組みはこれまで十分に理解されていませんでした。今回私達は、以前報告した微小管順行性輸送の制御因子・Rab1Aのエフェクター分子としてSKIP/PLEKHM2を同定することに成功しました。SKIPは順行性のモーターであるキネシンIと結合し、メラノソームを輸送することが明らかになりました。また、SKIPはリソソーム上のArl8と呼ばれる別の低分子量Gタンパク質とも結合し、リソソームの輸送にも関わることから、SKIP-キネシンIはRab1AとArl8を独立のカーゴレセプターとして用いて二種類のオルガネラを輸送し分ける機構が示唆されました。）

 

15-3) Etoh, K. and Fukuda, M. (2015) Structure-function analyses of the small GTPase Rab35 and its efffector protein centaurin-β2/ACAP2 during neurite outgrowth of PC12 cells. J. Biol. Chem. 290, 9064-9074 [PubMed]（Rab35はリサイクリングエンドソームからの小胞輸送を制御し、神経突起伸長、細胞分裂、細胞移動など様々な生理現象に関与します。Rab35は7種類以上のエフェクター分子と結合することが知られていますが、それらのRab35認識の分子基盤はこれまで明らかではありませんでした。今回私達は、Rab35とcentaurin-β2の構造機能相関に関する研究を行い、結合に必須なアミノ酸の同定に初めて成功しました。Rab35のスイッチII領域に存在する二つのThr残基に変異を加えたRab35変異体では、centaurin-β2との結合のみが欠損し、神経突起の伸長を促進する効果が消失していました。今後、この変異体を用いることによりRab35・centaurin-β2複合体がどのような生理現象に関与するのかを解析するのに有用と考えられます。）

 

15-4) Amagai, Y., Itoh, T., Fukuda, M. and Mizuno, K. (2015) Rabin8 suppresses autophagosome formation independently of its guanine nucleotide-exchange activity towards Rab8. J. Biochem. 158, 139-153 [PubMed]

 

15-5) Yasuda, T., Homma, Y. and Fukuda, M. (2015) Slp2-a inactivates ezrin by recruiting protein phosphatase 1 to the plasma membrane. Biochem. Biophys. Res. Commun. 460, 896-902 [PubMed]（Slp2-aはMDCK細胞における極性輸送や細胞の大きさ制御に関与しており、Slp2-a欠損細胞では細胞肥大の症状を示すことが知られています。この細胞肥大にはezrinと呼ばれるシグナル分子の過剰な活性化が関与することが示唆されていましたが、その詳細な仕組みはこれまで明らかではありませんでした。今回私達は、Slp2-aの新たな結合分子としてPP1と呼ばれるホスファターゼを同定し、このPP1が細胞膜上でezrinを脱リン酸化することにより、細胞の大きさをコンパクトに保つことを明らかにしました。）

 

15-6) Imai, A., Tsujimura, M., Yoshie, S. and Fukuda, M. (2015) The small GTPase Rab33A participates in regulation of amylase release from parotid acinar cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 461, 469-474 [PubMed]（日本歯科大学の今井あかね博士との共同研究で、Rab33Aが外分泌細胞である唾液腺腺房細胞の分泌顆粒上にも存在し、アミラーゼの分泌に関与することを突き止めました。）

 

15-7) Shimada-Sugawara, M., Sakai, E., Okamoto, K., Fukuda, M., Izumi, T., Yoshida, N. and Tsukuba, T. (2015) Rab27A regulates transport of cell surface receptors modulating multinucleation and lysosome-related organelles in osteoclasts. Sci. Rep. 5, 9620 [PubMed]

 

15-8) Egami, Y., Fujii, M., Kawai, K., Ishikawa, Y., Fukuda, M. and Araki, N. (2015) Activation-inactivation cycling of Rab35 and ARF6 is required for phagocytosis of zymosan in RAW264 macrophages. J. Immunol. Res. 2015:429439 [PubMed]

 

15-9) Aizawa, M. and Fukuda, M. (2015) Small GTPase Rab2B and its specific binding protein Golgi-associated Rab2B interactor-like 4 (GARI-L4) regulate Golgi morphology. J. Biol. Chem. 290, 22250-22261 [PubMed]（Rabによる膜輸送はゴルジ体などオルガネラの形態やアイデンティティーに重要と考えられています。今回私達は、ゴルジ体の形態に関わるRab分子の網羅的機能解析を行い、少なくとも六つのRab分子（Rab1A/1B/2A/2B/6B/8A）がHeLa-S3細胞のコンパクトなゴルジ体の形態維持に関与することを突き止めました。また、進化的に保存性が高く類似の機能を持つと推測されていたRab2AとRab2Bがゴルジ体の形態維持においては独立に機能することを明らかにし、Rab2B特異的な結合分子としてGARI-L4を同定することに成功しました。）

 

（2014年）

 

14-1) Ikawa, K., Satou, A., Fukuhara, M., Matsumura, S. Sugiyama, N., Goto, H., Fukuda, M., Inagaki, M., Ishihama, Y. and Toyoshima, F. (2014) Inhibition of endocytic vesicle fusion by Plk1-mediated phosphorylation of vimentin during mitosis. Cell Cycle 13, 126-137 [PubMed]

 

14-2) Yasuda, T. and Fukuda, M. (2014) Slp2-a controls renal epithelial cell size through regulation of Rap–ezrin signaling independently of Rab27. J. Cell Sci. 127, 557-570 [PubMed]（Slp2-aはRab27エフェクターとして機能することにより頂端部細胞膜への小胞輸送に関与することが知られていましたが、今回私達はSlp2-aがRab27Aの機能とは無関係にMDCK細胞（腎臓尿細管上皮細胞由来）の大きさを制御することを突き止めました。すなわち、Slp2-aはこれまで機能が明らかではなかったC2Bドメインを介してRap1GAP2を細胞膜にリクルートし、細胞の大きさをコンパクトに保つ役割を担っていました。腎臓肥大を伴う嚢胞性腎疾患のモデルマウスでは、Slp2-aの異常な発現も観察され、嚢胞性腎疾患発症との関連性も明らかになりました。）［リンク］

 

14-3) Azouz, N. P., Zur, N., Efergan, A., Ohbayashi, N., Fukuda, M., Amihai, D., Hammel, I., Rothenberg, M. E. and Sagi-Eisenberg, R. (2014) Rab5 is a novel regulator of mast cell secretory granules: impact on size, cargo and exocytosis. J. Immunol. 192, 4043-4053 [PubMed] (表紙に採用されました！)

 

14-4) Ishida, M., Arai, S. P., Ohbayashi, N. and Fukuda, M. (2014) The GTPase-deficient Rab27A(Q78L) mutant inhibits melanosome transport in melanocytes through trapping of Rab27A effector protein Slac2-a/melanophilin in their cytosol: Development of a novel melanosome-targeting tag. J. Biol. Chem. 289, 11059-11067 [PubMed]（メラノソームはメラニン色素を合成・貯蔵する特殊なオルガネラです。メラノソームで機能する分子はメラノソームに特異的に輸送される必要がありますが、これまでメラノソームへの輸送シグナルはほとんど分かっていませんでした。今回私達は、メラノソームの微小管逆行性輸送を制御するメラノレギュリン分子を改変し、任意の分子を成熟メラノソームに付着させる新規タグ(MST, melanosome-targeting tag)を開発することに成功しました。）［リンク］

 

14-5) Takano, T., Urushibara, T., Yoshioka, N., Saito, T., Fukuda, M., Tomomura, M. and Hisanaga, S. (2014) LMTK1 regulates dendritic formation by regulating movement of Rab11A-positive endosomes. Mol. Biol. Cell 25, 1755-1768 [PubMed]

 

14-6) Matsui, T., Noguchi, K. and Fukuda, M. (2014) Dennd3 functions as a guanine nucleotide exchange factor for small GTPase Rab12 in mouse embryonic fibroblasts. J. Biol. Chem. 289, 13986-13995 [PubMed]（Rab12は細胞膜上のアミノ酸トランスポーターPAT4の分解を制御することで細胞内アミノ酸量を調節し、mTORC1の活性化やオートファジーの制御に関与することがこれまでに明らかになっていますが、Rab12がどのように活性化されるのかといった時空間的な制御基盤は未だ解明されていません。今回私達は、Rab12の上流に位置する活性化因子としてDennd3という蛋白質を同定し、その機能解析を行いました。）

 

14-7) Sugeno, N., Hasegawa, T., Tanaka, N., Fukuda, M., Wakabayashi, K., Oshima, R., Konno, M., Miura, E., Kikuchi, A., Baba, T., Anan, T., Nakao, M., Geisler, S., Aoki, M. and Takeda, A. (2014) Lys-63-linked ubiquitination by E3 ubiquitin ligase Nedd4-1 facilitates endosomal sequestration of internalized α-synuclein. J. Biol. Chem. 289, 18137-18151 [PubMed]

 

14-8) Kobayashi, H., Etoh, K. and Fukuda, M. (2014) Rab35 is translocated from Arf6-positive perinuclear recycling endosomes to neurite tips during neurite outgrowth. Small GTPases 5, e29290 [PubMed]（Rab35は神経成長因子（NGF）依存的な神経突起伸長に不可欠な因子で、NGF刺激後にリサイクリングエンドソームに集積することがこれまで明らかになっています。今回私達は、神経突起形成後のRab35の動態を解析し、Rab35がリサイクリングエンドソームから神経突起の先端に移動することを明らかにしました。これらの結果から、Rab35はリサイクリングエンドソームから神経突起の先端への小胞輸送を促進し、何らかの分子を突起の先端に供給しているものと考えられます。）

 

14-9) Mori, Y., Fukuda, M. and Henley, J. M. (2014) Small GTPase Rab17 regulates the surface expression of kainate receptors but not α-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA) receptors in hippocampal neurons via dendritic trafficking of Syntaxin-4 protein. J. Biol. Chem. 289, 20773-20787 [PubMed]（英国ブリストル大学に留学した森靖典博士との共同研究で、樹状突起に特異的に局在するRab17がシンタキシン4の輸送を介して、カイニン酸受容体の細胞表面への発現を制御することを明らかにしました。）

 

14-10) Nishiyama, H., Koizumi, M., Ogawa, K., Kitamura, S., Konyuba, Y., Watanabe, Y. Ohbayashi, N., Fukuda, M., Suga, M. and Sato, C. (2014) Atmospheric scanning electron microscope system with an open sample chamber: Configuration and applications. Ultramicroscopy 147, 86-97 [PubMed]

 

14-11) Kobayashi, H., Etoh, K., Ohbayashi, N. and Fukuda, M. (2014) Rab35 promotes the recruitment of Rab8, Rab13 and Rab36 to recycling endosomes through MICAL-L1 during neurite outgrowth. Biol. Open 3, 803-814 [PubMed]（Rab35は神経成長因子（NGF）依存的にリサイクリングエンドソームにMICAL-L1などのエフェクター分子をリクルートすることにより、神経突起の伸長を促進します。今回私達は、MICAL-L1がRab35だけでなく複数のRabと結合することに着目し、Rab35-MICAL-L1がリサイクリングエンドソームにさらにRab8, Rab13, Rab36を集積させることを見出しました（「Rabクラスター化」と命名）。これらのRabはさらにJIP4などの特異的なエフェクター分子をリサイクリングエンドソームに呼び込むことで、神経突起方向への小胞輸送を促進するものと考えられました。）

 

14-12) Arango Duque, G., Fukuda, M., Turco, S. J., Stäger, S. and Descoteaux, A. (2014) Leishmania promastigotes induce cytokine secretion in macrophages through the degradation of Synaptotagmin XI. J. Immunol. 193, 2363-2372 [PubMed]

 

14-13) Nishikimi, A., Ishihara, S., Ozawa, M., Etoh, K., Fukuda, M., Kinashi, T. and Katagiri, K. (2014) Rab13 acts downstream of the kinase Mst1 to deliver the integrin LFA-1 to the cell surface for lymphocyte trafficking. Sci. Signal. 7, ra72 [PubMed]

 

14-14) McGough, I. J., Steinberg, F., Gallon, M., Yatsu, A., Ohbayashi, N., Heesom, K., Fukuda, M. and Cullen, P. J. (2014) Identification of molecular heterogeneity in SNX27-retromer-mediated endosome-to-plasma membrane recycling. J. Cell Sci. 127, 4940-4953 [PubMed]（In this issueに選定）（掲載後はMost-read Articlesにも入り着目されました！）

 

14-15) Gallo, L. I., Liao, Y., Ruiz, W. G., Clayton, D. R., Li, M., Liu, Y.-J., Jiang, Y., Fukuda, M., Apodaca, G. and Yin, X.-M. (2014) TBC1D9B functions as a GTPase-activating protein for Rab11a in polarized MDCK cells. Mol. Biol. Cell 25, 3779-3797 [PubMed]（Faculty of 1000のRecommended paperとして選定）

 

（2013年）

 

13-1) Onoue, K., Jofuku, A., Ban-Ishihara, R., Ishihara, T., Maeda, M., Koshiba, T., Itoh, T., Fukuda, M., Otera, H., Oka, T., Takano, H., Mizushima, N., Mihara, K. and Ishihara, N. (2013) Fis1 acts as a mitochondrial recruitment factor for TBC1D15 that is involved in regulation of mitochondrial morphology. J. Cell Sci. 126, 176-185 [PubMed]（In this issueに選定）

 

13-2) Nagai, H., Yasuda, S., Ohba, Y., Fukuda, M. and Nakamura, T. (2013) All members of the EPI64 subfamily of TBC/RabGAPs also have GAP activities toward Ras. J. Biochem. 153, 283-288 [PubMed]

 

13-3) Arango Duque, G., Fukuda, M. and Descoteaux, A. (2013) Synaptotagmin XI regulates phagocytosis and cytokine secretion in macrophages. J. Immunol. 190, 1737-1745 [PubMed]

 

13-4) Mori, Y., Matsui, T. and Fukuda, M. (2013) Rabex-5 protein regulates dendritic localization of small GTPase Rab17 and neurite morphogenesis in hippocampal neurons. J. Biol. Chem. 288, 9835-9847 [PubMed]（私達はこれまで樹状突起のみに局在し、樹状突起の形態形成やポストシナプスの形成に関与するRab17を同定していますが、その活性化機構は謎に包まれていました。今回私達は、Rab17の活性化因子としてRabex-5を見出すことに成功しました。Rabex-5はRab5, Rab17を含む複数の活性化因子として作用し、樹状突起のみならず、軸索の形態形成にも関与することが明らかになりました。）

 

13-5) Matsui, T. and Fukuda, M. (2013) Rab12 regulates mTORC1 activity and autophagy through controlling the degradation of amino-acid transporter PAT4. EMBO Rep. 14, 450-457 [PubMed]（オートファジーはダイナミックな膜動態を伴う細胞内分解系ですが、Rab分子の関与は未だ十分に解明されていません。今回私達はマウスに存在する全てのRabを対象としたノックダウン実験により、新たなオートファジー制御因子としてRab12を同定しました。Rab12は細胞膜上のアミノ酸トランスポーターPAT4の分解を制御することにより細胞内アミノ酸量の調節に関与し、mTORC1の活性に影響を与えることで間接的にオートファジーの制御を行うという新規の分子機構を解明しました。）［リンク］（hot off the pressに選定）（掲載後はTop downlaodsにも入り着目されました！）

 

13-6) Chiba, S., Amagai, Y., Homma, Y., Fukuda, M. and Mizuno, K. (2013) NDR2-mediated Rabin8 phosphorylation is crucial for ciliogenesis by switching binding specificity from phosphatidylserine to Sec15. EMBO J. 32, 874-885 [PubMed]

 

13-7) Yatsu, A., Ohbayashi, N., Tamura, K. and Fukuda, M. (2013) Syntaxin-3 is required for melanosomal localization of Tyrp1 in melanocytes. J. Invest. Dermatol. 133, 2237-2246 [PubMed]（メラノソームの中でメラニン色素を合成するためには、メラニン合成酵素をメラノソームの中へ輸送する必要がありますが、小胞で運ばれて来たメラニン合成酵素がどのようにメラノソームに受け渡されるのかはこれまで分かっていませんでした。今回私達はマウスの培養メラノサイトを用いて、この過程に膜の融合装置であるSNAREタンパク質syntaxin-3、SNAP23、VAMP7の複合体が関与することを初めて明らかにしました。）［リンク］

 

13-8) Kobayashi, H. and Fukuda, M. (2013) Rab35 establishes the EHD1-association site by coordinating two distinct effectors during neurite outgrowth. J. Cell Sci. 126, 2424-2435 [PubMed]（神経突起が伸長するためには、細胞体からの膜や蛋白質の供給が不可欠で、この過程には低分子量G蛋白質Rab35が重要な役割を果たしていますが、その詳細な機能は未だ明らかになっていません。今回私達は、Rab35がcentaurin β2に加え、MICAL-L1という別のエフェクター分子を核周辺のリサイクリングエンドソームにリクルートすることを見出しました。Rab35をこれらの分子との結合を通して、分子ハサミ（molecular scissors）のEHD1が働く場を提供し、小胞のくびりとりと突起方向への輸送を促すものと考えられました。）

 

13-9) Fuchigami, T., Sato, Y., Tomita, Y., Takano, T., Miyauchi, S., Tsuchiya, Y., Saito, T., Kubo, K., Nakajima, K., Fukuda, M., Hattori, M. and Hisanaga, S. (2013) Dab1-mediated colocalization of multi-adaptor protein CIN85 with Reelin-receptors, ApoER2 and VLDLR, in neurons. Genes Cells 18, 410-424 [PubMed]

 

13-10) Mori, Y., Matsui, T., Omote, D. and Fukuda, M. (2013) Small GTPase Rab39A interacts with UACA and regulates the retinoic acid-induced neurite morphology of Neuro2A cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 435, 113-119 [PubMed]（Rab39は動物界に広く保存されたRabアイソフォームで、哺乳動物ではRab39AとRab39Bの二種類が存在しています。Rab39Bの変異はヒトのX連鎖精神遅延を引き起こしますが、その発症の仕組みは未だ解明されていません。本論文では、Rab39の神経系における役割を明らかにするため、Rab39に特異的なエフェクター分子の同定を試みました。その結果、UACAという分子がRab39に特異的に結合すること、Rab39AとUACAはNeuro2A細胞の神経突起の樹状様形態を制御することが明らかとなりました。）

 

13-11) Bar-Gill, A. B., Efergan, A., Seger, R., Fukuda, M. and Sagi-Eisenberg, R. (2013) The extra-cellular signal regulated kinases ERK1 and ERK2 segregate displaying distinct spatiotemporal characteristics in activated mast cells. Biochim. Biophys. Acta - Mol. Cell Res. 1833, 2070-2082 [PubMed]

 

13-12) Imai, A., Ishida, M., Fukuda, M., Nashida, T. and Shimomura, H. (2013) MADD/DENN/Rab3GEP functions as a guanine nucleotide exchange factor for Rab27 during granule exocytosis of rat parotid acinar cells. Arch. Biochem. Biophys. 536, 31-37 [PubMed]

 

13-13) Kobayashi, H. and Fukuda, M. (2013) Arf6, Rab11 and transferrin receptor define distinct populations of recycling endosomes. Commun. Integr. Biol. 6, e25036 [PubMed]（リサイクリングエンドソームは細胞膜上の受容体蛋白質などのリサイクリングに関与することが知られていますが、神経突起の伸長のための膜供給源としても近年注目を集めています。Arf6、Rab11、トランスフェリン受容体はリサイクリングエンドソームのマーカーとして良く知られていますが、PC12細胞の神経突起伸長過程では、これらのマーカーが全く異なる細胞内局在を示すことを本論文で見出しました。リサイクリングエンドソームには機能の異なるサブドメインが存在し、神経突起伸長時には、Arf6陽性の中心体近傍のリサイクリングエンドソームが重要な役割を果たすものと考えられます。）

 

13-14) Ljubicic, S., Bezzi, P., Brajkovic, S., Nesca, V., Guay, C., Ohbayashi, N., Fukuda, M., Abderrahmani, A. and Regazzi, R. (2013) The GTPase Rab37 participates in the control of insulin exocytosis. PLoS One 8, e68255 [PubMed]

 

13-15) Fujita, N., Morita, E., Itoh, T., Tanaka, A., Nakaoka, M., Osada, Y., Umemoto, T., Saitoh, T., Nakatogawa, H., Kobayashi, S., Haraguchi, T., Guan, J. L., Iwai, K., Tokunaga, F., Saito, K., Ishibashi, K., Akira, S., Fukuda, M., Noda, T. and Yoshimori, T. (2013) Recruitment of the autophagic machinery to endosomes during infection is mediated by ubiquitin. J. Cell Biol. 203, 115-128 [PubMed]（Faculty of 1000のRecommended paperとして選定）

 

（2012年）

 

12-1) Brozzi, F., Diraison, F., Lajus, S., Rajatileka, S., Philips, T., Regazzi, R., Fukuda, M., Verkade, P., Molnár, E. and Varadi, A. (2012) Molecular mechanism of myosin Va recruitment to dense core secretory granules. Traffic 13, 54-69 [PubMed]

 

12-2) Ohbayashi, N., Maruta, Y., Ishida, M. and Fukuda, M. (2012) Melanoregulin regulates retrograde melanosome transport through interaction with the RILP–p150Glued complex in melanocytes. J. Cell Sci. 125, 1508-1518 [PubMed]（Rab27Aを遺伝的に欠損するメラノサイトでは、アクチン依存性のメラノソーム輸送障害のため、メラノソームが核周辺で強く凝集します。面白いことに、この凝集はdsu遺伝子のさらなる欠損によりレスキューされ、正常な毛色に戻ることが古くから知られています。しかし、その復帰の分子機構は30年近く解明されていませんでした。今回私達は、dsuの遺伝子産物Mregが逆行性の微小管モーターと相互作用することにより、核周辺にメラノソームを凝集させていることを初めて突き止めました。）［リンク］（In this issueに選定）

 

12-3) Ohbayashi, N., Yatsu, A., Tamura, K. and Fukuda, M. (2012) The Rab21-GEF activity of Varp, but not its Rab32/38 effector function, is required for dendrite formation in melanocytes. Mol. Biol. Cell 23, 669-678 [PubMed]（Rab32/38のエフェクターとして同定されたVarp分子には、Rab32/38を結合するANKR1ドメインに加え、Rab21を活性化するVPS9ドメインが存在します。しかし、これまでVPS9ドメインのメラノサイトでの機能は明らかではありませんでした。今回私達は、このVPS9ドメインに樹状突起の形成促進作用があることを突き止めました。すなわち、Varpは分子内に存在する二つのRabシグナリングドメイン（ANKR1ドメインとVPS9ドメイン）の機能を使い分けることにより、「メラニン合成酵素の輸送」と「樹状突起の形成」という二つの異なる輸送プロセスを制御する多機能分子であることが明らかになりました）［リンク］

 

12-4) Chesneau, L., Dambournet, D., Machicoane, M., Kouranti, I., Fukuda, M., Goud, B. and Echard, A. (2012) An ARF6/Rab35 GTPase cascade for endocytic recycling and successful cytokinesis. Curr. Biol. 22, 147-153 [PubMed]

 

12-5) Kobayashi, H. and Fukuda, M. (2012) Rab35 regulates Arf6 activity through centaurin-β2 (ACAP2) during neurite outgrowth. J. Cell Sci. 125, 2235-2243 [PubMed]（神経ネットワークを構築するためには、神経細胞が正しく神経突起を伸ばすことが不可欠です。今回私達は、Rab35とそのエフェクター分子centaruin β2が、核周辺のリサイクリングエンドソームに存在するArf6を不活性化することにより、神経突起の伸長過程を制御することを明らかにしました。二種類の異なる低分子量Gタンパク質、Rab35とArf6の新たなクロストークの発見です！）（In this issueに選定）

 

12-6) Mori, Y., Matsui, T., Furutani, Y., Yoshihara, Y. and Fukuda, M. (2012) Small GTPase Rab17 regulates dendritic morphogenesis and postsynaptic development of hippocampal neurons. J. Biol. Chem. 287, 8963-8973 [PubMed]（私達の脳を構成する神経細胞は、軸索と樹状突起を伸ばし、シナプスを形成することにより神経細胞のネットワークを形成しています。軸索方向には軸索でのみで機能する分子、樹状突起には樹状突起でのみで機能する分子を輸送すること（極性輸送）が不可欠ですが、これまでその分子機構は十分に解明されていませんでした。今回私達は、樹状突起のみに局在する新規RabとしてRab17を同定することに成功しました。Rab17はfilopodia形成を通して、樹状突起やスパインの形成に関与することが明らかになりました。）（Faculty of 1000のRecommended paperとして選定）

 

12-7) Gao, J., Takeuchi, H., Zhang, Z., Fukuda, M. and Hirata, M. (2012) Phospholipase C-related but catalytically inactive protein (PRIP) modulates synaptosomal-associated protein 25 (SNAP-25) phosphorylation and exocytosis. J. Biol. Chem. 287, 10565-10578 [PubMed]

 

12-8) Takano, T., Tomomura, M., Yoshioka, N., Tsutsumi, K., Terasawa, Y., Saito, T., Kawano, H., Kamiguchi, H., Fukuda, M. and Hisanaga, S. (2012) LMTK1/AATYK1 is a novel regulator of axonal outgrowth that acts via Rab11 in a Cdk5-dependent manner. J. Neurosci. 32, 6587-6599 [PubMed]

 

12-9) Ishida, M., Ohbayashi, N., Maruta, Y., Ebata, Y. and Fukuda, M. (2012) Functional involvement of Rab1A in microtubule-dependent anterograde melanosome transport in melanocytes. J. Cell Sci. 125, 5177-5187 [PubMed]（メラノサイトでは、微小管とアクチン線維に沿ってメラノソームが細胞膜周辺まで輸送されます。これまで、微小管上の逆行性輸送とアクチン輸送の仕組みの解明に成功していますが、微小管上の順行性輸送の仕組みは長らく明らかではありませんでした。今回私達は、低分子量Gタンパク質Rabファミリーを網羅的にスクリーニングすることにより、Rab1AというこれまでGolgi-ER間の輸送に関与することが知られていたRabアイソフォームが順行性のメラノソーム輸送に関与することを突き止めました。）［リンク］（In this issueに選定）

 

12-10) Ishibashi, K., Uemura, T., Waguri, S. and Fukuda, M. (2012) Atg16L1, an essential factor for canonical autophagy, participates in hormone secretion from PC12 cells independently of autophagic activity. Mol. Biol. Cell 23, 3193-3202 [PubMed][USACO]（最近、オートファジーと分泌制御の関連性が示唆されていますが、オートファジー制御因子による分泌の制御機構は良く分っていませんでした。今回私達は、隔離膜の伸長に必須の因子Atg16L1がRab33Aと結合することにより、PC12細胞のホルモン顆粒上に局在し、オートファジー活性とは無関係にホルモン分泌を制御することを明らかにしました。）

 

12-11) Yasuda, T., Saegusa, C., Kamakura, S., Sumimoto, H. and Fukuda, M. (2012) Rab27 effector Slp2-a transports the apical signaling molecule podocalyxin to the apical surface of MDCK II cells and regulates claudin-2 expression. Mol. Biol. Cell 23, 3229-3239 [PubMed][USACO]（Rab27エフェクターSlp2-aはメラノサイトでの機能が良く知られていますが、上皮細胞でも発現が見られます。今回私達は、極性化したMDCK細胞でSlp2-aのタンパク質量が顕著に上昇すること、Slp2-a–Rab27Aがシグナル分子・podocalyxinを頂端部細胞膜に輸送し、MAPKシグナル系を活性化して密着結合を形成するclaudin-2の発現を誘導することを明らかにしました。）

 

12-12) Matsui, T., Ohbayashi, N. and Fukuda, M. (2012) The Rab interacting lysosomal protein (RILP) homology domain functions as a novel effector domain for small GTPase Rab36: Rab36 regulates retrograde melanosome transport in melanocytes. J. Biol. Chem. 287, 28619-28631 [PubMed]（低分子量Gタンパク質Rabは哺乳動物に60種類近く存在するため、多くのRabアイソフォームの機能は未だ十分に解明されていません。今回私達は、機能未知のRab36というアイソフォームに着目し、そのエフェクター分子の探索を行いました。Rab36結合分子の多くはRILP homology domain (RHD)と命名した領域を含んでおり、このRHDにGTP型のRab36が結合することを明らかにしました。また、メラノサイトを用いた解析から、Rab36はRILPを介してダイニン-ダイナクチンモーターと複合体を形成し、メラノソームの微小管逆行性輸送を制御することを突き止めました。）

 

12-13) Azouz, N. P., Matsui, T., Fukuda, M. and Sagi-Eisenberg, R. (2012) Decoding the regulation of mast cell exocytosis by networks of Rab GTPases. J. Immunol. 189, 2169-2180 [PubMed]

 

12-14) Zografou, S., Basagiannis, D., Papafotika, A., Shirakawa, R., Horiuchi, H., Auerbach, D., Fukuda, M. and Christoforidis, S. (2012) A complete Rab screening reveals novel insights in Weibel–Palade body exocytosis. J. Cell Sci. 125, 4780-4790 [PubMed]（In this issueに選定）

 

12-15) Gálvez-Santisteban, M., Rodriguez-Fraticelli, A. E., Bryant, D. M., Vergarajauregui, S., Yasuda, T., Bañón-Rodríguez, I., Bernascone, I., Datta, A., Spivak, N., Young, K., Slim, C. L., Brakeman, P. R., Fukuda, M., Mostov, K. E. and Martín-Belmonte, F. (2012) Synaptotagmin-like proteins control the formation of a single apical membrane domain in epithelial cells. Nature Cell Biol. 14, 838-849 [PubMed]

 

12-16) Yoshida-Amano, Y., Hachiya, A., Ohuchi, A., Kobinger, G. P., Kitahara, T., Takema, Y. and Fukuda, M. (2012) Essential role of RAB27A in determining constitutive human skin color. PLoS One 7, e41160 [PubMed]（花王株式会社との共同研究で、人種による肌の色の違いの原因について調べました。黒人由来のメラノサイトでも、白人由来のメラノサイトでもメラニン合成酵素の発現量には差がありませんが、メラノソームの輸送に必須の因子Rab27Aの発現量に有意な差が認められました。すなわち、黒人由来のメラノサイトでは、Rab27Aの発現が高くメラノソームの輸送活性が高いために、多くのメラノソームがケラチノサイトに受け渡されるものと考えられます。）

 

12-17) Nagahama, M., Umezaki, M., Tashiro, R., Oda, M., Kobayashi, K., Shibutani, M., Takagishi, T., Ishidoh, K., Fukuda, M. and Sakurai, J. (2012) Intracellular trafficking of Clostridium perfringens iota-toxin b. Infect. Immun. 80, 3410-3416 [PubMed]

 

12-18) Nakazawa, H., Sada, T., Toriyama, M., Tago, K., Sugiura, T., Fukuda, M. and Inagaki, N. (2012) Rab33a mediates anterograde vesicular transport for membrane exocytosis and axon outgrowth. J. Neurosci. 32, 12712-12725 [PubMed] (表紙に採用されました！)［リンク］

 

（2011年）

 

11-1) Tamura, K., Ohbayashi, N., Ishibashi, K. and Fukuda, M. (2011) Structure-function analysis of VPS9-ankyrin-repeat protein (Varp) in the trafficking of tyrosinase-related protein 1 in melanocytes. J. Biol. Chem. 286, 7507-7521 [PubMed]（メラニン合成酵素チロシナーゼ関連蛋白質1(Tyrp1)の輸送におけるVarp分子の各ドメインの機能を明らかにするため、構造機能相関に関する研究を行いました。Tyrp1の輸送にはVarp分子のRab32/38結合能及びVAMP7結合能が必須であるが、VPS9ドメインのRab21-GEF活性は必要ないことが明らかになりました。）

 

11-2) Itoh, T., Kanno, E., Uemura, T., Waguri, S. and Fukuda, M. (2011) OATL1, a novel autophagosome-resident Rab33B-GAP, regulates autophagosomal maturation. J. Cell Biol. 192, 839-853 [PubMed]（近年Rabの不活性化因子として注目されているTBC蛋白質は、ヒトやマウスには40種類以上存在しますが、それらの詳細な機能はほとんど分っていません。本論文では、オートファゴソームに局在するTBC蛋白質の網羅的な解析を行い、OATL1/TBC1D25がLC3/Atg8依存的にオートファゴソームにリクルートし、オートファゴソームの成熟過程に関与することを初めて突き止めました。）

 

11-3) Matsuoka, H., Harada, K., Nakamura, J., Fukuda, M. and Inoue, M. (2011) Differential distribution of synaptotagmin-1, -4, -7, and -9 in rat adrenal chromaffin cells. Cell Tissue Res. 344, 41-50 [PubMed]

 

11-4) Beaumont, K. A., Hamilton, N. A., Moores, M. T., Brown, D. L., Ohbayashi, N., Cairncross, O., Cook, A. L., Smith, A. G., Misaki, R., Fukuda, M., Taguchi, T., Sturm, R. A. and Stow, J. L. (2011) The recycling endosome protein Rab17 regulates melanocytic filopodia formation and melanosome trafficking. Traffic 12, 627-643 [PubMed]

 

11-5) Sasakawa, N., Ohara-Imaizumi, M., Fukuda, M., Kabayama, H., Mikoshiba, K. and Kumakura, K. (2011) Dissociation of inositol polyphosphates from the C2B domain of synaptotagmin facilitates spontaneous release of catecholamines in adrenal chromaffin cells: A suggestive evidence of a fusion clamp by synaptotagmin. Neuropharmacology 60, 1364-1370 [PubMed]

 

11-6) Egami, Y., Fukuda, M. and Araki, N. (2011) Rab35 regulates phagosome formation through recruitment of ACAP2 in macrophages during FcγR-mediated phagocytosis. J. Cell Sci. 124, 3557-3567 [PubMed] （In this issueに選定）

 

11-7) Vinet, A. F., Jananji, S., Turco, S. J., Fukuda, M. and Descoteaux, A. (2011) Exclusion of synaptotagmin V at the phagocytic cup by Leishmania donovani lipophosphoglycan results in decreased promastigote internalization. Microbiology 157, 2619-2628 [PubMed]

 

11-8) Matsui, T., Itoh, T. and Fukuda, M. (2011) Small GTPase Rab12 regulates constitutive degradation of transferrin receptor. Traffic 12, 1432-1443 [PubMed]（細胞膜上の受容体蛋白質はリガンドが結合すると細胞内に取り込まれ、一部の受容体はリサイクリング経路により再び細胞膜へと輸送されます。しかし、トランスフェリン受容体などリサイクリング経路で再利用される受容体の品質管理機構はこれまでほとんど明らかではありませんでした。今回私達は、これまで機能が明らかではなかったRab12がトランスフェリン受容体をリソソームに輸送し恒常的に分解することを見い出しました。リサイクリングエンドソームからリソソームに輸送する経路は教科書にも記載されていない新規経路で、今後の更なる発展が期待されます。）

 

11-9) Fukuda, M., Kobayashi, H., Ishibashi, K. and Ohbayashi, N. (2011) Genome-wide investigation of the Rab binding activity of RUN domains: Development of a novel tool that specifically traps GTP-Rab35. Cell Struct. Funct. 36, 155-170 [PubMed]（ヒトのゲノム上には、低分子量G蛋白質Rabとの関連性が示唆されている機能未知のドメインが多数存在しています。RUNドメインもその一つで、Rabエフェクター候補と考えられていましたが、これまで十分な検証は行われていませんでした。今回私達は、ヒトに存在する全てのRUNドメインを対象にRabの結合活性を網羅的に調べ、新たなRab結合ドメインの同定を行いました。さらに、その結果をもとにGTP-Rab35の新規トラッパーの開発に成功しました。）

 

11-10) Zhang, L., Yu, K., Robert, K. W., DeBolt, K. M., Hong, N., Tao, J.-Q., Fukuda, M., Fisher, A. B. and Huang, S. (2011) Rab38 targets to lamellar bodies and normalizes their sizes in lung alveolar type II epithelial cells. Am. J. Physiol. Lung Cell. Mol. Physiol. 301, L461-L477 [PubMed] （Faculty of 1000のRecommended paperとして選定）

 

11-11) Imai, A., Yoshie, S., Ishibashi, K., Haga-Tsujimura, M., Nashida, T., Shimomura, H. and Fukuda, M. (2011) EPI64 protein functions as a physiological GTPase-activating protein for Rab27 protein and regulates amylase release in rat parotid acinar cells. J. Biol. Chem. 286, 33854-33862 [PubMed]（日本歯科大学・今井あかね先生のグループとの共同研究で、耳下腺からのアミラーゼ分泌におけるRab27-GAP、EPI64の機能解析を行いました。分泌刺激と共にEPI64のRab27-GAP活性が上昇し、Rab27が不活性化されることがアミラーゼの分泌に必須であることを初めて突き止めました。）

 

11-12) Doi, H., Yoshida, K., Yasuda, T., Fukuda, M., Fukuda, Y., Morita, H., Ikeda, S.-I., Kato, R., Tsurusaki, Y., Miyake, N., Saitsu, H., Sakai, H., Miyatake, S., Shiina, M., Nukina, N., Koyano, S., Tsuji, S., Kuroiwa, Y. and Matsumoto, N. (2011) Exome sequencing reveals a homozygous SYT14 mutation in adult-onset autosomal recessive spinocerebellar ataxia with psychomotor retardation. Am. J. Hum. Genet. 89, 320-327 [PubMed]

 

11-13) Ishibashi, K., Fujita, N., Kanno, E., Omori, H., Yoshimori, T., Itoh, T. and Fukuda, M. (2011) Atg16L2, a novel isoform of mammalian Atg16L that is not essential for canonical autophagy despite forming an Atg12–5-16L2 complex. Autophagy 7, 1500-1513 [PubMed]（オートファゴソーム（特に隔離膜）の形成に必須の因子、Atg16L1の類似分子としてほ乳動物にのみ保存されたAtg16L2を同定しました。Atg16L2はAtg16L1と同様にAtg12-5と複合体を形成するにも関わらず、隔離膜には局在せず、飢餓応答性のオートファジーには関与しないという意外な事実が明らかになりました。Atg16L1とAtg16L2の比較解析から、Atg16L1のアミノ酸229-242の領域に何らかの未同定の因子が結合し、隔離膜へのAtg16L1の局在を制御している可能性が示唆されました。）

 

（2010年）

 

10-1) Tsuboi, T., Kitaguchi, T., Karasawa, S., Fukuda, M. and Miyawaki, A. (2010) Age-dependent preferential dense-core vesicle exocytosis in neuroendocrine cells revealed by newly developed monomeric fluorescent timer protein. Mol. Biol. Cell 21, 87-94 [PubMed] （A Highlights from MBoC Selectionに選定）

 

10-2) Ostrowski, M., Carmo, N. B., Krumeich, S., Fanget, I., Raposo, G., Savina, A., Moita, C. F., Schauer, K., Hume, A. N., Freitas, R. P., Goud, B., Benaroch, P., Hacohen, N., Fukuda, M., Desnos, C., Seabra, M. C., Darchen, F., Amigorena, S., Moita, L. F. and Thery, C. (2010) Rab27a and Rab27b control different steps of the exosome secretion pathway. Nature Cell Biol. 12, 19-30 [PubMed]

 

10-3) Lico, D. T. P., Rosa, J. C., DeGiorgis, J. A., deVasconcelos, E. J. R., Casaletti, L., Tauhata, S. B. F., Baqui, M. M. A., Fukuda, M., Moreira, J. E. and Larson, R. E. (2010) A novel 65 kDa RNA-binding protein in squid presynaptic terminals. Neuroscience 166, 73-83 [PubMed]

 

10-4) Ko, H. W., Norman, R. X., Tran, J., Fuller, K. P., Fukuda, M. and Eggenschwiler, J. T. (2010) Broad-minded links cell cycle-related kinase to cilia assembly and hedgehog signal transduction. Dev. Cell 18, 237-247 [PubMed] （Faculty of 1000のRecommended paperとして選定）

 

10-5) Kanno, E., Ishibashi, K., Kobayashi, H., Matsui, T., Ohbayashi, N. and Fukuda, M. (2010) Comprehensive screening for novel Rab-binding proteins by GST pull-down assay using 60 different mammalian Rabs. Traffic 11, 491-507 [PubMed]（マウスやヒトに存在する60種類のRabアイソフォームに対するエフェクター分子をGST pull-down法と質量分析を組み合わせて網羅的にスクリーニングしました。その結果、Rabとその不活性化因子GAPの間に新しいタイプの結合様式が存在すること（Rabの結合による特定のオルガネラへのGAPのリクルート）を明らかにしました。また、全てのRabを対象に網羅的な解析を行った世界で初めての論文です！）（Traffic 2010-2011のmost cited paperの一つに選ばれました！）

 

10-6) Schlager, M. A., Kapitein, L. C., Grigoriev, I., Burzynski, G. M., Wulf, P. S., Keijzer, N., de Graaff, E., Fukuda, M., Shepherd, I. T., Akhmanova, A. and Hoogenraad, C. C. (2010) Pericentrosomal targeting of Rab6 secretory vesicles by Bicaudal-D-related protein-1 (BICDR-1) regulates neuritogenesis. EMBO J. 29, 1637-1651 [PubMed] （Faculty of 1000のRecommended paperとして選定）

 

10-7) Sato, M., Mori, Y., Matsui, T., Aoki, R., Oya, M., Yanagihara, Y., Fukuda, M. and Tsuboi, T. (2010) Role of the polybasic sequence in the Doc2α C2B domain in dense-core vesicle exocytosis in PC12 cells. J. Neurochem. 114, 171-181 [PubMed]（東大・坪井貴司先生のグループとの共同研究で、Doc2αC2Bドメインのt-SNARE結合サイトの調節性分泌における役割を明らかにしました。シンタキシン1a／SNAP-25ヘテロダイマーの結合能を欠損するDoc2α(KQ)変異体をPC12細胞に発現すると、細胞膜上の分泌顆粒数が減少するとともに、その開口放出数が顕著に減少することを見出しました。）

 

10-8) Ohbayashi, N., Mamishi, S., Ishibashi, K., Maruta, Y., Pourakbari, B., Tamizifar, B., Mohammadpour, M., Fukuda, M. and Parvaneh, N. (2010) Functional characterization of two Rab27A missense mutations found in Griscelli syndrome type 2. Pigment Cell Melanoma Res. 23, 365-374 [PubMed]（タイプ2型グリセリ症候群の新しいミスセンス変異（Rab27A(K22R)及び(I44T)）の解析を行いました。K22R変異体はGTP結合能を欠損し、細胞質中に存在すること、I44T変遺体はメラノソーム上に存在するにも関わらず、Slac2-aとの結合できないために、色素異常の症状を呈することを明らかにしました。）

 

10-9) Tsutsumi, K., Takano, T., Endo, R., Fukuda, M., Ohshima, T., Tomomura, M. and Hisanaga, S. (2010) Phosphorylation of AATYK1 by Cdk5 suppresses its tyrosine phosphorylation. PLoS One 5, e10260 [PubMed]

 

10-10) Harada, K., Matsuoka, H., Nakamura, J., Fukuda, M. and Inoue, M. (2010) Storage of GABA in chromaffin granules and not in synaptic-like microvesicles in rat adrenal medullary cells. J. Neurochem. 114, 617-626 [PubMed]

 

10-11) Takano, T., Tsutsumi, K., Saito, T., Asada, A., Tomomura, M., Fukuda, M. and Hisanaga, S. (2010) AATYK1A phosphorylation by Cdk5 regulates the recycling endosome pathway. Genes Cells 15, 783-797 [PubMed]

 

（2009年）

 

09-1) Ishibashi, K., Kanno, E., Itoh, T. and Fukuda, M. (2009) Identification and characterization of a novel Tre-2/Bub2/Cdc16 (TBC) protein that possesses Rab3A-GAP activity. Genes Cells 14, 41-52 [PubMed]（TBCドメインはRab-GAPドメインと考えられており、ヒトのゲノム上には40種類以上のTBC蛋白質が存在しますが、実際にRab-GAPとして同定されているものは僅かです。本論文では、ホルモン顆粒からのRab3Aの遊離を指標にして、Rab3A-GAP活性を有するTBC蛋白質のin vivoでのスクリーニング法を確立しました。）

 

09-2) Imai, A., Fukuda, M., Yoshie, S., Nashida, T. and Shimomura, H. (2009) Redistribution of Rab27-specific effector Slac2-c, but not Slp4-a, after isoproterenol-stimulation in rat parotid acinar cells. Arch. Oral Biol. 54, 361-368 [PubMed]

 

09-3) Imai, A., Yoshie, S., Nashida, T., Fukuda, M. and Shimomura, H. (2009) Redistribution of small GTP-binding protein, Rab27B, in rat parotid acinar cells after stimulation with isoproterenol. Eur. J. Oral Sci. 117, 224-230 [PubMed]

 

09-4) Tambe, Y., Yamamoto, A., Isono, T., Chano, T., Fukuda, M. and Inoue, H. (2009) The drs tumor suppressor is involved in the maturation process of autophagy induced by low serum. Cancer Lett. 283, 74-83 [PubMed]

 

09-5) Tamura, K., Ohbayashi, N., Maruta, Y., Kanno, E., Itoh, T. and Fukuda, M. (2009) Varp is a novel Rab32/38-binding protein that regulates Tyrp1 trafficking in melanocytes. Mol. Biol. Cell 20, 2900-2908 [PubMed]（メラニン合成酵素チロシナーゼ関連蛋白質1(Tyrp1)の輸送に関与する新規蛋白質としてRab32/38エフェクターVarpを同定しました！Varpを欠損するメラノサイトではメラノソームにTyrp1が正しく輸送されず、細胞内のメラニン色素量が減少することが明らかになりました）［リンク］

 

09-6) Arimura, N., Kimura, T., Nakamuta, S., Taya, S., Funahashi, Y., Hattori, A., Shimada, A., Ménager, C., Kawabata, S., Fujii, K., Iwamatsu, A., Segal, R. A., Fukuda, M. and Kaibuchi, K. (2009) Anterograde transport of TrkB in axons is mediated by direct interaction with Slp1 and Rab27. Dev. Cell 16, 675-686 [PubMed]

 

09-7) Maekawa, F., Tsuboi, T., Fukuda, M. and Pellerin, L. (2009) Regulation of the intracellular distribution, cell surface expression, and protein levels of AMPA receptor GluR2 subunits by the monocarboxylate transporter MCT2 in neuronal cells. J. Neurochem. 109, 1767-1778 [PubMed]

 

09-8) Terabayashi, T., Funato, Y., Fukuda, M. and Miki, H. (2009) A coated vesicle-associated kinase of 104 kDa (CVAK104) induces lysosomal degradation of frizzled 5 (Fzd5). J. Biol. Chem. 284, 26716-26724 [PubMed] （Faculty of 1000のRecommended paperとして選定）

 

09-9) Vinet, A. F., Fukuda, M., Turco, S. J. and Descoteaux, A. (2009) The Leishmania donovani lipophosphoglycan excludes the vesicular proton-ATPase from phagosomes by impairing the recruitment of Synaptotagmin V. PLoS Pathog. 5, e1000628 [PubMed]

 

09-10) Miyakawa, K., Ryo, A., Murakami, T., Ohba, K., Yamaoka, S., Fukuda, M., Guatelli, J. and Yamamoto, N. (2009) BCA2/Rabring7 promotes tetherin-dependent HIV-1 restriction. PLoS Pathog. 5, e1000700 [PubMed]

 

（2008年）

 

08-1) Gauthier, B. R., Duhamel, D. L., Iezzi, M., Theander, S., Saltel, F., Fukuda, M., Wehrle-Haller, B. and Wollheim, C. B. (2008) Synaptotagmin VII splice variants α, β, and δ are expressed in pancreatic β-cells and regulate insulin exocytosis. FASEB J. 22, 194-206 [PubMed]

 

08-2) Mori, Y., Higuchi, M., Hirabayashi, Y., Fukuda, M. and Gotoh, Y. (2008) JNK phosphorylates synaptotagmin-4 and enhances Ca2+-evoked release. EMBO J. 27, 76-87 [PubMed]

 

08-3) Kanno, E. and Fukuda, M. (2008) Increased plasma membrane localization of O-glycosylation-deficient mutant of synaptotagmin I in PC12 cells. J. Neurosci. Res. 86, 1036-1043 [PubMed]（JNR誌の表紙に採用されました！シナプトタグミンI分子の輸送におけるO糖鎖修飾の意義を解析しました。）

 

08-4) Sano, H., Roach, W. G., Peck, G. R., Fukuda, M. and Lienhard, G. E. (2008) Rab10 in insulin-stimulated GLUT4 translocation. Biochem. J. 411, 89-95 [PubMed]

 

08-5) Holt, O., Kanno, E., Bossi, G., Booth, S., Daniele, T., Santoro, A., Arico, M., Saegusa, C., Fukuda, M. and Griffiths, G. M. (2008) Slp1 and Slp2-a localize to the plasma membrane of CTL and contribute to secretion from the immunological synapse. Traffic 9, 446-457 [PubMed]（細胞傷害性T細胞に発現するRab27AエフェクターとしてSlp2-aを同定し、Slp2-aが免疫シナプスに集積することを突き止めました。）

 

08-6) Frittoli, E., Palamidessi, A., Pizzigoni, A., Lanzetti, L., Garrè, M., Troglio, F., Troilo, A., Fukuda, M., Di Fiore, P. P., Scita, G. and Confalonieri, S. (2008) The primate-specific protein TBC1D3 is required for optimal macropinocytosis in a novel ARF6 dependent pathway. Mol. Biol. Cell 19, 1304-1316 [PubMed]

 

08-7) Fujibayashi, A., Taguchi, T., Misaki, R., Ohtani, M., Dohmae, N., Takio, K., Yamada, M., Gu, J., Yamakami, M., Fukuda, M., Waguri, S., Uchiyama, Y., Yoshimori, T. and Sekiguchi, K. (2008) Human RME-8 is involved in membrane trafficking through early endosomes. Cell Struct. Funct. 33, 35-50 [PubMed]

 

08-8) Fukuda, M., Kanno, E., Ishibashi, K. and Itoh, T. (2008) Large scale screening for novel Rab effectors reveals unexpected broad Rab binding specificity. Mol. Cell. Proteomics 7, 1031-1042 [PubMed]（Rab1～Rab30のエフェクター分子をRab two-hybrid panelを用いて網羅的にスクリーニングしました。その結果、Rabとエフェクター分子の対応関係は以前考えられていた以上に複雑であることが明らかになりました。エフェクター分子のRab結合特異性を詳細に調べた初めての論文です！）

 

08-9) Martin, D., Allagnat, F., Chaffard, G., Caille, D., Fukuda, M., Regazzi, R., Abderrahmani, A., Waeber, G., Meda, P., Maechler, P. and Haefliger, J.-A. (2008) Functional significance of repressor element 1 silencing transcription factor (REST) target genes in pancreatic beta cells. Diabetologia 51, 1429-1439 [PubMed]

 

08-10) Fujita, N., Itoh, T., Omori, H., Fukuda, M., Noda, T. and Yoshimori, T. (2008) The Atg16L complex specifies the site of LC3 lipidation for membrane biogenesis in autophagy. Mol. Biol. Cell 19, 2092-2100 [PubMed]（Faculty of 1000のMust read paperとして選定）

 

08-11) Itoh, T., Fujita, N., Kanno, E., Yamamoto, A., Yoshimori, T. and Fukuda, M. (2008) Golgi-resident small GTPase Rab33B interacts with Atg16L and modulates autophagosome formation. Mol. Biol. Cell 19, 2916-2925 [PubMed]（Rabの網羅的解析ツールを用いて、オートファジー（特に隔離膜伸長）に必須の因子Atg16LがRab33Bのエフェクター分子として機能する可能性を初めて明らかにしました。ダイナミックな膜輸送を伴うオートファジーと膜輸送の制御因子であるRabとが直接結びついた初めての論文です！）（Faculty of 1000のRecommended paperとして選定）

 

08-12) Saegusa, C., Kanno, E., Itohara, S. and Fukuda, M. (2008) Expression of Rab27B-binding protein Slp1 in pancreatic acinar cells and its involvement in amylase secretion. Arch. Biochem. Biophys. 475, 87-92 [PubMed]（Rab27エフェクターSlp1は、膵臓の外分泌（acinar）細胞に最も豊富に発現しており、Slp1ノックアウトマウスでは絶食時に見られるアミラーゼの分泌が低下していることが明らかになりました。）

 

08-13) Patino-Lopez, G., Dong, X., Ben-Aissa, K., Bernot, K. M., Itoh, T., Fukuda, M., Kruhlak, M. J., Samelson, L. E. and Shaw, S. (2008) Rab35 and its GAP EPI64C in T cells regulate receptor recycling and immunological synapse formation. J. Biol. Chem. 283, 18323-18330 [PubMed]

 

08-14) Kukimoto-Niino, M., Sakamoto, A., Kanno, E., Hanawa-Suetsugu, K., Terada, T., Shirouzu, M., Fukuda, M. and Yokoyama, S. (2008) Structural basis for the exclusive specificity of Slac2-a/melanophilin for the Rab27 GTPases. Structure 16, 1478-1490 [PubMed]（理研・横山茂之先生のグループとの共同研究で、Rab27B-Slac2-a-SHDのX線結晶構造を決定しました。Slac2-aのSHDがRab27のみを特異的に認識する機構が解明されただけでなく、Griscelli症候群患者に見られる変異ではRab27-Slac2-aの結合が損なわれることが構造学的にも裏付けられました。）［リンク］（Faculty of 1000のRecommended paperとして選定）

 

08-15) Herrero-Turrión, M. J., Calafat, J., Janssen, H., Fukuda, M. and Mollinedo, F. (2008) Rab27a regulates exocytosis of tertiary and specific granules in human neutrophils. J. Immunol. 181, 3793-3803 [PubMed]

 

08-16) Kesari, A., Fukuda, M., Knoblach, S., Bashir, R., Nader, G. A., Rao, D., Nagaraju, K. and Hoffman, E. P. (2008) Dysferlin-deficiency shows compensatory induction of Rab27A/Slp2a that may contribute to inflammatory onset. Am. J. Pathol. 173, 1476-1487 [PubMed]

 

08-17) Vinet, A. F., Fukuda, M. and Descoteaux, A. (2008) The exocytosis regulator synaptotagmin V controls phagocytosis in macrophages. J. Immunol. 181, 5289-5295 [PubMed]

 

08-18) Yu, E., Kanno, E., Choi, S., Sugimori, M., Moreira, J. E., Llinás, R. R. and Fukuda, M. (2008) Role of Rab27 in synaptic transmission at the squid giant synapse. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 105, 16003-16008 [PubMed]（Rab27は内分泌細胞、外分泌細胞、免疫細胞などの様々な分泌現象に関与することが知られていますが、神経細胞のシナプス小胞輸送における役割はこれまで明らかではありませんでした。本論文では、Rab27が線虫からヒトまで進化的に保存されていることに着目し、ヤリイカの巨大軸索を用いてリサイクリング小胞のactive zoneへの輸送及びドッキング過程に関与することを初めて明らかにしました。）［リンク］

 

（2007年）

 

07-1) Tsuboi, T., Kanno, E. and Fukuda, M. (2007) The polybasic sequence in the C2B domain of rabphilin is required for the vesicle docking step in PC12 cells. J. Neurochem. 100, 770-779 [PubMed]

 

07-2) Kishida, S., Hamao, K., Inoue, M., Hasegawa, M., Matsuura, Y., Mikoshiba, K., Fukuda, M. and Kikuchi, A. (2007) Dvl regulates endo- and exocytotic processes through binding to synaptotagmin. Genes Cells 12, 49-61 [PubMed]

 

07-3) Iwashita, S., Kobayashi, K., Kubo, Y., Hinohara, Y., Sezaki, M., Nakamura, K., Suzuki-Migishima, R., Yokoyama, M., Satoh, S., Fukuda, M., Ohba, M., Kato, C., Adachi, E. and Song, S.-Y. (2007) Versatile roles of R-Ras GAP in neurite formation of PC12 cells and embryonic vascular development. J. Biol. Chem. 282, 3413-3417 [PubMed]

 

07-4) Tsuboi, T. and Fukuda, M. (2007) Synaptotagmin VII modulates the kinetics of dense-core vesicle exocytosis in PC12 cells. Genes Cells 12, 511-519 [PubMed]

 

07-5) Hashii, M., Fukuda M., Nomura, H., Ito, N., Takahashi, H., Hattori, S., Mikoshiba, K., Noda, M. and Higuchi, Y. (2007) Up-regulation of ras-GAP genes is reversed by a MEK inhibitor and doxorubicin in v-Ki-ras transformed NIH/3T3 fibroblasts. Biochem. Biophys. Res. Commun. 356, 374-380 [PubMed]

 

07-6) Sano, H., Eguez, L., Teruel, M. N., Fukuda, M., Chuang, T. D., Chavez, J. A., Lienhard, G. E. and McGraw, T. E. (2007) Rab10, a target of the AS160 Rab GAP, is required for insulin-stimulated translocation of GLUT4 to the adipocyte plasma membrane. Cell Metab. 5, 293-303 [PubMed]

 

07-7) Haberman, Y., Ziv, I., Gorzalczany, Y., Hirschberg, K., Mittleman, L., Fukuda, M. and Sagi-Eisenberg, R. (2007) Synaptotagmin (Syt) IX is an essential determinant for protein sorting to secretory granules in mast cells. Blood 109, 3385-3392 [PubMed]

 

07-8) Musch, M. W., Arvans, D. L., Walsh-Reitz, M. M., Uchiyama, K., Fukuda, M. and Chang, E. B. (2007) Synaptotagmin I binds intestinal epithelial NHE3 and mediates cyclic AMP- and Ca2+-induced endocytosis by recruitment of AP2 and clathrin. Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol. 292, G1549-1558 [PubMed]

 

07-9) Brunner, Y., Couté, Y., Iezzi, M., Foti, M., Fukuda, M., Hochstrasser, D., Wollheim, C. B. and Sanchez, J.-C. (2007) Proteomic analysis of insulin secretory granules. Mol. Cell. Proteomics 6, 1007-1017 [PubMed]

 

07-10) Takahashi, M., Murate, M., Fukuda, M., Sato, S. B., Ohta, A. and Kobayashi, T. (2007) Cholesterol controls lipid endocytosis through rab11. Mol. Biol. Cell 18, 2667-2677 [PubMed]（Faculty of 1000のRecommended paperとして選定）

 

07-11) Misaki, R., Nakagawa, T., Fukuda, M., Taniguchi, N. and Taguchi, T. (2007) Spatial segregation of degradation- and recycling-trafficking pathways in COS-1 cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 360, 580-585 [PubMed]

 

07-12) Swiatecka-Urban, A., Talebian, L., Kanno, E., Moreau-Marquis, S., Coutermarsh, B., Hansen, K., Karlson, K. H., Barnaby, R., Cheney, R. E., Langford, G. M., Fukuda, M. and Stanton, B. A. (2007) Myosin Vb is required for trafficking of cystic fibrosis transmembrane conductance regulator in Rab11a-specific apical recycling endosomes in polarized human airway epithelial cells. J. Biol. Chem. 282, 23725-23736 [PubMed]

 

（2006年）

 

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06-4) Saxena, S. K., Horiuchi, H. and Fukuda, M. (2006) Rab27a regulates epithelial sodium channel (ENaC) activity through synaptotagmin-like protein (SLP-5) and Munc13-4 effector mechanism. Biochem. Biophys. Res. Commun. 344, 651-657 [PubMed]

 

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06-6) Tsuboi, T. and Fukuda, M. (2006) Rab3A and Rab27A cooperatively regulate the docking step of dense-core vesicle exocytosis in PC12 cells. J. Cell Sci. 119, 2196-2203 [PubMed]

 

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06-10) Itoh, T., Satoh, M., Kanno, E. and Fukuda, M. (2006) Screening for target Rabs of TBC (Tre-2/Bub2/Cdc16) domain-containing proteins based on their Rab-binding activity. Genes Cells 11, 1023-1037 [PubMed]（Rab60種類とTBC蛋白質40種類の結合を網羅的に解析することによりRab-GAPの同定を試みました。）

 

06-11) Kapp-Barnea, Y., Ninio-Many, L., Hirschberg, K., Fukuda, M., Jeromin, A. and Sagi-Eisenberg, R. (2006) Neuronal calcium sensor-1 (NCS-1) and PI4Kβ stimulate ERK1/2 signaling by accelerating recycling through endocytic recycling compartment (ERC). Mol. Biol. Cell 17, 4130-4141 [PubMed]

 

06-12) Kondo, H., Shirakawa, R., Higashi, T., Kawato, M., Fukuda, M., Kita, T. and Horiuchi, H. (2006) Constitutive GDP/GTP exchange and secretion-dependent GTP hydrolysis activity for Rab27 in platelets. J. Biol. Chem. 281, 28657-28665 [PubMed]

 

06-13) Itoh, T. and Fukuda, M. (2006) Identification of EPI64 as a GTPase-activating protein specific for Rab27A. J. Biol. Chem. 281, 31823-31831 [PubMed] （Rab27A不活性化酵素Rab27A-GAPを同定！）［リンク］

 

06-14) Imai, A., Yoshie, S., Nashida, T., Shimomura, H. and Fukuda, M. (2006) Functional involvement of Noc2, a Rab27 effector, in rat parotid acinar cells. Arch. Biochem. Biophys. 455, 127-135 [PubMed]

 

（2005年）

　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　

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05-2) Haberman, Y., Ziv, I., Gorzalczany, Y., Fukuda, M. and Sagi-Eisenberg, R. (2005) Classical protein kinase C(s) regulates targeting of synaptotagmin IX to the endocytic recycling compartment. J. Cell Sci. 118, 1641-1649 [PubMed]

 

05-3) Kuroda, T. S. and Fukuda, M. (2005) Functional analysis of Slac2-c/MyRIP as a linker protein between melanosomes and myosin VIIa. J. Biol. Chem. 280, 28015-28022 [PubMed]

 

05-4) Mîinea, C. P., Sano, H., Kane, S., Sano, E., Fukuda, M., Peränen, J., Lane, W. S. and Lienhard, G. E. (2005) AS160, the Akt substrate regulating GLUT4 translocation, has a functional Rab GTPase activating protein domain. Biochem. J. 391, 87-93 [PubMed]

 

05-5) Roggero, C. M., Tomes, C. N., De Blas, G. A., Castillo, J., Michaut, M. A., Fukuda, M. and Mayorga, L. S. (2005) Protein Kinase C-mediated phosphorylation of the two polybasic regions of synaptotagmin VI regulates their function in acrosomal exocytosis. Dev. Biol. 285, 422-435 [PubMed]

 

05-6) Iezzi, M., Eliasson, L., Fukuda, M. and Wollheim, C. B. (2005) Adenovirus-mediated silencing of Synaptotagmin 9 inhibits Ca2+-dependent insulin secretion in islets. FEBS Lett. 579, 5241-5246 [PubMed]

 

05-7) Saxena, S., Singh, M., Engisch, K., Fukuda, M. and Kaur, S. (2005) Rab proteins regulate epithelial sodium channel activity in colonic epithelial HT-29 cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 337, 1219-1223 [PubMed]

 

05-8) Swiatecka-Urban, A., Brown, A., Moreau-Marquis, S., Renuka, J., Coutermarsh, B., Barnaby, R., Karlson, K. H., Flotte, T. R., Fukuda, M., Langford, G. M. and Stanton, B. A. (2005) The short apical membrane half-life of rescued ΔF508-cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) results from accelerated endocytosis of ΔF508-CFTR in polarized human airway epithelial cells. J. Biol. Chem. 280, 36762-36772 [PubMed]

 

05-9) Fukuda, M., Imai, A., Nashida, T. and Shimomura, H. (2005) Slp4-a/granuphilin-a interacts with syntaxin-2/3 in a Munc18-2-dependent manner. J. Biol. Chem. 280, 39175-39184 [PubMed]

 

05-10) Tsuboi, T. and Fukuda, M. (2005) The C2B domain of rabphilin directly interacts with SNAP-25 and regulates the docking step of dense core vesicle exocytosis in PC12 cells. J. Biol. Chem. 280, 39253-39259 [PubMed] （内分泌細胞におけるホルモン顆粒の細胞膜へのつなぎ止めの新分子機構を解明！）［リンク］

 

（2004年）

 

04-1) Sadakata, T., Mizoguchi, A., Sato, Y., Katoh-Semba, R., Fukuda, M., Mikoshiba, K. and Furuichi, T. (2004) The secretory granule-associated protein CAPS2 regulates neurotrophin release and cell survival. J. Neurosci. 24, 43-52 [PubMed]

 

04-2) Fukuda, M. and Kuroda, T. S. (2004) Missense mutations in the globular tail of myosin-Va in dilute mice partially impair binding of Slac2-a/melanophilin. J. Cell Sci. 117, 583-591 [PubMed]

 

04-3) Shirakawa, R., Higashi, T., Tabuchi, A., Yoshioka, A., Nishioka, H., Fukuda, M., Kita, T. and Horiuchi, H. (2004) Munc13-4 is a GTP-Rab27-binding protein regulating dense core granule secretion in platelets. J. Biol. Chem. 279, 10730-10737 [PubMed]

 

04-4) Rickman, C., Archer, D. A., Meunier, F. A., Craxton, M., Fukuda, M., Burgoyne, R. D. and Davletov, B. (2004) Synaptotagmin interaction with the syntaxin/SNAP-25 dimer is mediated by an evolutionarily conserved motif and is sensitive to inositol hexakisphosphate. J. Biol. Chem. 279, 12574-12579 [PubMed]

 

04-5) Fukuda, M., Kanno, E. and Yamamoto, A. (2004) Rabphilin and Noc2 are recruited to dense-core vesicles through specific interaction with Rab27A in PC12 cells. J. Biol. Chem. 279, 13065-13075 [PubMed]

 

04-6) Imai, A., Yoshie, S., Nashida, T., Shimomura, H. and Fukuda, M. (2004) The small GTPase Rab27B regulates amylase release from rat parotid acinar cells. J. Cell Sci. 117, 1945-1953 [PubMed]

 

04-7) Fukuda, M. and Itoh, T. (2004) Slac2-a/melanophilin contains multiple PEST-like sequences that are highly sensitive to proteolysis. J. Biol. Chem. 279, 22314-22321 [PubMed]

 

04-8) Fukuda, M. (2004) RNA interference-mediated silencing of synaptotagmin IX, but not synaptotagmin I, inhibits dense-core vesicle exocytosis in PC12 cells. Biochem. J. 380, 875-879 [PubMed]

 

04-9) Iezzi, M., Kouri, G., Fukuda, M. and Wollheim, C. B. (2004) Synaptotagmin V and IX isoforms control Ca2+-dependent insulin exocytosis. J. Cell Sci. 117, 3119-3127 [PubMed]

 

04-10) Zhang, Q., Fukuda, M., Van Bockstaele, E., Pascual, O. and Haydon, P. G. (2004) Synaptotagmin IV regulates glial glutamate release. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101, 9441-9446 [PubMed]

 

04-11) Fukuda, M. (2004) Alternative splicing in the first α-helical region of the Rab-binding domain of Rim regulates Rab3A binding activity: Is Rim a Rab3 effector protein during evolution? Genes Cells 9, 831-842 [PubMed]

 

04-12) Fukuda, M. and Yamamoto, A. (2004) Effect of forskolin on synaptotagmin IV protein trafficking in PC12 cells. J. Biochem. 136, 245-253 [PubMed]

 

04-13) Kuroda, T. S. and Fukuda, M. (2004) Rab27A-binding protein Slp2-a is required for peripheral melanosome distribution and elongated cell shape in melanocytes. Nature Cell Biol. 6, 1195-1203 [PubMed] （Rab27A, Slac2-a, Slp2-aを介するメラニン色素輸送の分子メカニズムを解明しました。）［リンク］

 

04-14) Fukuda, M., Kanno, E., Satoh, M., Saegusa, C. and Yamamoto, A. (2004) Synaptotagmin VII is targeted to dense-core vesicles and regulates their Ca2+-dependent exocytosis in PC12 cells. J. Biol. Chem. 279, 52677-52684 [PubMed]

 

04-15) Llinás, R. R., Sugimori, M., Moran, K. A., Moreira, J. E. and Fukuda, M. (2004) Vesicular reuptake inhibition by a synaptotagmin I C2B domain antibody at the squid giant synapse. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101, 17855-17860 [PubMed]

 

（2003年）

 

03-1) Fukuda, M., Kanno, E., Ogata, Y., Saegusa, C., Kim, T., Peng Loh, Y. and Yamamoto, A. (2003) Nerve growth factor-dependent sorting of synaptotagmin IV protein to mature dense-core vesicles that undergo calcium-dependent exocytosis in PC12 cells. J. Biol. Chem. 278, 3220-3226 [PubMed]

 

03-2) Bahadoran, P., Busca, R., Chiaverini, C., Westbroek, W., Lambert, J., Bille, K., Valony, G., Fukuda, M., Naeyaert, J.-M., Ortonne, J.-P. and Ballotti, R. (2003) Characterization of the molecular defects in Rab27a, caused by RAB27A missense mutations found in patients with Griscelli syndrome. J. Biol. Chem. 278, 11386-11392 [PubMed]

 

03-3) Fukuda, M. (2003) Distinct Rab binding specificity of Rim1, Rim2, rabphilin, and Noc2: Identification of a critical determinant of Rab3A/Rab27A recognition by Rim2. J. Biol. Chem. 278, 15373-15380 [PubMed] （Rab結合特異性を網羅的に解析するシステムを構築！）

 

03-4) Fukuda, M. (2003) Slp4-a/granuphilin-a inhibits dense-core vesicle exocytosis through interaction with the GDP-bound form of Rab27A in PC12 cells. J. Biol. Chem. 278, 15390-15396 [PubMed]

 

03-5) Fukuda, M. (2003) Molecular cloning, expression, and characterization of a novel class of synaptotagmin (Syt XIV) conserved from Drosophila to humans. J. Biochem. 133, 641-649 [PubMed]

 

03-6) Fukuda, M. (2003) Molecular cloning and characterization of human, rat, and mouse synaptotagmin XV. Biochem. Biophys. Res. Commun. 306, 64-71 [PubMed]

 

03-7) Kuroda, T. S., Ariga, H. and Fukuda, M. (2003) The actin-binding domain of Slac2-a/melanophilin is required for melanosome distribution in melanocytes. Mol. Cell. Biol. 23, 5245-5255 [PubMed]

 

03-8) Sato, M., Moroi, K., Nishiyama, M., Zhou, J., Usui, H., Kasuya, Y., Fukuda, M., Kohara, Y., Komuro, I. and Kimura, S. (2003) Characterization of a novel C. elegans RGS protein with a C2 domain: Evidence for direct association between C2 domain and Gaq subunit. Life Sci. 73, 917-932 [PubMed]

 

03-9) Haberman, Y., Grimberg, E., Fukuda, M. and Sagi-Eisenberg, R. (2003) Synaptotagmin IX, a possible linker between the perinuclear endocytic recycling compartment and the microtubules. J. Cell Sci. 116, 4307-4318 [PubMed]

 

03-10) Waselle, L., Coppola, T., Fukuda, M., Iezzi, M., El-Amraoui, A., Petit, C. and Regazzi, R. (2003) Involvement of the Rab27 binding protein Slac2c/MyRIP in insulin exocytosis. Mol. Biol. Cell 14, 4103-4113 [PubMed]

 

03-11) Yoo, S., Nguyen, M. P., Fukuda, M., Bittner, G. D. and Fishman, H. M. (2003) Plasmalemmal sealing of transected mammalian neurites is a gradual process mediated by Ca2+-regulated proteins. J. Neurosci. Res. 74, 541-551 [PubMed]

 

（2002年）

 

02-1) Fukuda, M., Kowalchyk, J. A., Zhang, X., Martin, T. F. J. and Mikoshiba, K. (2002) Synaptotagmin IX regulates Ca2+-dependent secretion in PC12 cells. J. Biol. Chem. 277, 4601-4604 [PubMed] （PC12細胞からのホルモン分泌に関与する新しいシナプトタグミンを同定！）

 

02-2) Kuroda, T. S., Fukuda, M., Ariga, H. and Mikoshiba, K. (2002) The Slp homology domain of synaptotagmin-like proteins 1-4 and Slac2 functions as a novel Rab27A binding domain. J. Biol. Chem. 277, 9212-9218 [PubMed] （SHD領域が低分子量G蛋白質Rab27A結合ドメインであることを発見！）

 

02-3) Fukuda, M., Kuroda, T. S. and Mikoshiba, K. (2002) Slac2-a/melanophilin, the missing link between Rab27 and myosin Va: Implications of a tripartite protein complex for melanosome transport. J. Biol. Chem. 277, 12432-12436 [PubMed] （Rab27A·Slac2-a·myosin Vaの複合体によりメラノソーム輸送を行うことを見いだす。JBC誌の表紙にもなりました。当該研究分野において被引用率で上位1%にもランクされました［リンク］。）（Faculty of 1000のRecommended paperとして選定）

 

02-4) Zhang, X., Kim-Miller, M. J., Fukuda, M., Kowalchyk, J. A. and Martin, T. F. J. (2002) Ca2+-dependent synaptotagmin binding to SNAP-25 is essential for Ca2+-triggered exocytosis. Neuron 34, 599-611 [PubMed]

 

02-5) Kuroda, T. S., Fukuda, M., Ariga, H. and Mikoshiba, K. (2002) Synaptotagmin-like protein 5: A novel Rab27A effector with C-terminal tandem C2 domains. Biochem. Biophys. Res. Commun. 293, 899-906 [PubMed]

 

02-6) Fukuda, M., Ogata, Y., Saegusa, C., Kanno, E. and Mikoshiba, K. (2002) Alternative splicing isoforms of synaptotagmin VII in the mouse, rat and human. Biochem. J. 365, 173-180 [PubMed]

 

02-7) Saegusa, C., Fukuda, M. and Mikoshiba, K. (2002) Synaptotagmin V is targeted to dense-core vesicles that undergo calcium-dependent exocytosis in PC12 cells. J. Biol. Chem. 277, 24499-24505 [PubMed]

 

02-8) Ibata, K., Hashikawa, T., Tsuboi, T., Terakawa, S., Liang, F., Mizutani, A., Fukuda, M. and Mikoshiba, K. (2002) Non-polarized distribution of synaptotagmin IV in neurons: Evidence that synaptotagmin IV is not a synaptic vesicle protein. Neurosci. Res. 43, 401-406 [PubMed]

 

02-9) Fukuda, M., Katayama, E. and Mikoshiba, K. (2002) The calcium-binding loops of the tandem C2 domains of synaptotagmin VII cooperatively mediate calcium-dependent oligomerization. J. Biol. Chem. 277, 29315-29320 [PubMed]

 

02-10) Fukuda, M. (2002) Vesicle-associated membrane protein-2/synaptobrevin binding to synaptotagmin I promotes O-glycosylation of synaptotagmin I. J. Biol. Chem. 277, 30351-30358 [PubMed]

 

02-11) Fukuda, M. (2002) The C2A domain of synaptotagmin-like protein 3 (Slp3) is an atypical calcium-dependent phospholipid-binding machine: Comparison with the C2A domain of synaptotagmin I. Biochem. J. 366, 681-687 [PubMed]

 

02-12) Fukuda, M., Kanno, E., Saegusa, C., Ogata, Y. and Kuroda, T. S. (2002) Slp4-a/granuphilin-a regulates dense-core vesicle exocytosis in PC12 cells. J. Biol. Chem. 277, 39673-39678 [PubMed]

 

02-13) Fukuda, M. (2002) Synaptotagmin-like protein (Slp) homology domain 1 of Slac2-a/melanophilin is a critical determinant of GTP-dependent specific binding to Rab27A. J. Biol. Chem. 277, 40118-40124 [PubMed]

 

02-14) Fukuda, M. and Kuroda, T. S. (2002) Slac2-c (synaptotagmin-like protein homologue lacking C2 domains-c), a novel linker protein that interacts with Rab27, myosin Va/VIIa, and actin. J. Biol. Chem. 277, 43096-43103 [PubMed]

 

02-15) Peng W., Premkumar, A., Mossner, R., Fukuda, M., Lesch, K. P. and Simantov, R. (2002) Synaptotagmin I and IV are differentially regulated in the brain by the recreational drug 3,4-methylenedioxymethamphetamine (MDMA). Mol. Brain Res. 108, 94-101 [PubMed]

 

（2001年）

 

01-1) Fukuda, M. and Mikoshiba, K. (2001) Characterization of KIAA1427 protein as an atypical synaptotagmin (Syt XIII). Biochem. J. 354, 249-257 [PubMed]

 

01-2) Fukuda, M. and Mikoshiba, K. (2001) Synaptotagmin-like protein 1-3: A novel family of C-terminal-type tandem C2 proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 281, 1226-1233 [PubMed] （シナプトタグミンに似て非なる新規分子を同定しSlpと命名）

 

01-3) Nalefski, E. A., Wisner, M. A., Chen, J. Z., Sprang, S. R., Fukuda, M., Mikoshiba, K. and Falke, J. J. (2001) C2 domains from different Ca2+ signaling pathways display functional and mechanistic diversity. Biochemistry 40, 3089-3100 [PubMed]

 

01-4) Gut, A., Kiraly, C. E., Fukuda, M., Mikoshiba, K., Wollheim, C. B. and Lang, J. (2001) Expression and localisation of synaptotagmin isoforms in endocrine β-cells: Their function in insulin exocytosis. J. Cell Sci. 114, 1709-1716 [PubMed]

 

01-5) Fukuda, M., Ibata, K. and Mikoshiba, K. (2001) A unique spacer domain of synaptotagmin IV is essential for Golgi localization. J. Neurochem. 77, 730-740 [PubMed]

 

01-6) Fukuda, M., Saegusa, C. and Mikoshiba, K. (2001) Novel splicing isoforms of synaptotagmin-like proteins 2 and 3: Identification of the Slp homology domain. Biochem. Biophys. Res. Commun. 283, 513-519 [PubMed] （後にRab27の結合ドメインとして同定されることになるSHD領域を見い出す）

 

01-7) Fukuda, M., Saegusa, C., Kanno, E. and Mikoshiba, K. (2001) The C2A domain of double C2 protein γ contains a functional nuclear localization signal. J. Biol. Chem. 276, 24441-24444 [PubMed]

 

01-8) Fukuda, M. and Mikoshiba, K. (2001) Mechanism of the calcium-dependent multimerization of synaptotagmin VII mediated by its first and second C2 domains. J. Biol. Chem. 276, 27670-27676 [PubMed]

 

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01-12) Fukuda, M., Yamamoto, A. and Mikoshiba, K. (2001) Formation of crystalloid endoplasmic reticulum induced by expression of synaptotagmin lacking the conserved WHXL motif in the C terminus: Structural importance of the WHXL motif in the C2B domain. J. Biol. Chem. 276, 41112-41119 [PubMed]

 

01-13) Minagawa, T., Fukuda, M. and Mikoshiba, K. (2001) Distinct phosphoinositide binding specificity of the GAP1 family proteins: Characterization of the pleckstrin homology domains of mrasal and kiaa0538. Biochem. Biophys. Res. Commun. 288, 87-90 [PubMed]

 

01-14) Fukuda, M. and Mikoshiba, K. (2001) The N-terminal cysteine cluster is essential for membrane targeting of B/K protein. Biochem. J. 360, 441-448 [PubMed]

 

01-15) Kida, Y., Sakaguchi, M., Fukuda, M., Mikoshiba, K. and Mihara, K. (2001) Amino acid residues before the hydrophobic region which are critical for membrane translocation of the N-terminal domain of synaptotagmin II. FEBS Lett. 507, 341-345 [PubMed]

 

（2000年）

 

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00-5) Detrait, E., Eddleman, C. S., Yoo, S., Fukuda, M., Nguyen, M. P., Bittner, G. D. and Fishman, H. M. (2000) Axolemmal repair requires proteins that mediate synaptic vesicle fusion. J. Neurobiol. 44, 382-391 [PubMed]

 

00-6) Fukuda, M. and Mikoshiba, K. (2000) Distinct self-oligomerization activities of synaptotagmin family: Unique calcium-dependent oligomerization properties of synaptotagmin VII. J. Biol. Chem. 275, 28180-28185 [PubMed]

 

00-7) Kida, Y., Sakaguchi, M., Fukuda, M., Mikoshiba, K. and Mihara, K. (2000) Membrane topogenesis of a type I signal-anchor protein, mouse synaptotagmin II, on the endoplasmic reticulum. J. Cell Biol. 150, 719-730 [PubMed]

 

00-8) Fukuda, M. and Mikoshiba, K. (2000) Calcium-dependent and -independent hetero-oligomerization in the synaptotagmin family. J. Biochem. 128, 637-645 [PubMed]

 

00-9) Detrait, E. R., Yoo, S., Eddleman, C. S., Fukuda, M., Bittner, G. D. and Fishman, H. M. (2000) Plasmalemmal repair of severed neurites of PC12 cells requires Ca2+ and synaptotagmin. J. Neurosci. Res. 62, 566-573 [PubMed]

 

00-10) Fukuda, M. and Mikoshiba, K. (2000) Doc2γ, a third isoform of double C2 protein, lacking calcium-dependent phospholipid binding activity. Biochem. Biophys. Res. Commun. 276, 626-632 [PubMed]

 

00-11) Fukuda, M., Kabayama, H. and Mikoshiba, K. (2000) Drosophila AD3 mutation of synaptotagmin impairs calcium-dependent self-oligomerization activity. FEBS Lett. 482, 269-272 [PubMed]

 

00-12) Fukuda, M. and Mikoshiba, K. (2000) Expression of synaptotagmin I or II promotes neurite outgrowth in PC12 cells. Neurosci. Lett. 295, 33-36 [PubMed]

 

00-13) Fukuda, M., Moreira, J. E., Liu, V., Sugimori, M., Mikoshiba, K. and Llinás, R. R. (2000) Role of the conserved WHXL motif in the C terminus of synaptotagmin in synaptic vesicle docking. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97, 14715-14719 [PubMed]

 

（1999年）

 

99-1) Kabayama, H., Takei, K., Fukuda, M., Ibata, K. and Mikoshiba, K. (1999) functional involvement of synaptotagmin I/II C2A domain in neurite outgrowth of chick dorsal root ganglion neuron. Neuroscience 88, 999-1003 [PubMed]

 

99-2) Fukuda, M., Kanno, E. and Mikoshiba, K. (1999) Conserved N-terminal cysteine motif is essential for homo- and heterodimer formation of synaptotagmins III, V, VI, and X. J. Biol. Chem. 274, 31421-31427 [PubMed] （理研脳センターに移って、シナプトタグミンファミリーをターゲットとした研究を開始！）

 

99-3) Fukuda, M. and Mikoshiba, K. (1999) A novel alternatively spliced variant of synaptotagmin VI lacking a transmembrane domain: Implications for distinct functions of the two isoforms. J. Biol. Chem. 274, 31428-31434 [PubMed]

 

（1998年）

 

98-1) Sugimori, M., Tong, C.-K., Fukuda, M., Moreira, J. E., Kojima, T., Mikoshiba, K. and Llinás, R. (1998) Presynaptic injection of syntaxin-specific antibodies blocks transmission in the squid giant synapse. Neuroscience 86, 39-51 [PubMed]

 

98-2) Ibata, K., Fukuda, M. and Mikoshiba, K. (1998) Inositol 1,3,4,5-tetrakisphosphate binding activities of neuronal and nonneuronal synaptotagmins: Identification of conserved amino acid substitutions that abolish inositol 1,3,4,5-tetrakisphosphate binding to synaptotagmins III, V, and X. J. Biol. Chem. 273, 12267-12273 [PubMed]

 

（1997年）

 

97-1) Ohara-Imaizumi, M., Fukuda, M., Niinobe, M., Misonou, H., Ikeda, K., Murakami, T., Kawasaki, M., Mikoshiba, K. and Kumakura, K. (1997) Distinct roles of C2A and C2B domains of synaptotagmin in the regulation of exocytosis in adrenal chromaffin cells. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94, 287-291 [PubMed]

 

97-2) Mehrotra, B., Elliott, J. T., Chen, J., Olszewski, J. D., Profit, A. A., Chaudhary, A., Fukuda, M., Mikoshiba, K. and Prestwich, G. D. (1997) Selective photoaffinity labeling of the inositol polyphosphate binding C2B domains of synaptotagmins. J. Biol. Chem. 272, 4237-4244 [PubMed]

 

97-3) Fukuda, M., Kojima, T. and Mikoshiba, K. (1997) Regulation by bivalent cations of phospholipid binding to the C2A domain of synaptotagmin III. Biochem. J. 323, 421-425 [PubMed]

 

97-4) Mochida, S., Fukuda, M., Niinobe, M., Kobayashi, H. and Mikoshiba, K. (1997) Roles of synaptotagmin C2 domains in neurotransmitter secretion and inositol high-polyphosphate binding at mammalian cholinergic synapses. Neuroscience 77, 937-943 [PubMed]

 

97-5) Kojima, T., Fukuda, M., Watanabe, Y., Hamazato, F. and Mikoshiba, K. (1997) Characterization of the pleckstrin homology domain of Btk as an inositol polyphosphate and phosphoinositide binding domain. Biochem. Biophys. Res. Commun. 236, 333-339 [PubMed]

 

97-6) Lang, J., Fukuda, M., Zhang, H., Mikoshiba, K. and Wollheim, C. B. (1997) The first C2 domain of synaptotagmin is required for exocytosis of insulin from pancreatic β-cells: Action of synaptotagmin at low micromolar calcium. EMBO J. 16, 5837-5846 [PubMed]

 

97-7) Taketo, M., Yokoyama, S., Fukuda, M., Mikoshiba, K. and Higashida, H. (1997) Inosiotl-1,3,4,5-tetrakisphosphate binding sites in control and ras-transformed NIH/3T3 fibroblasts. Biochem. Biophys. Res. Commun. 239, 349-352 [PubMed]

 

97-8) Mizutani, A., Fukuda, M., Niinobe, M. and Mikoshiba, K. (1997) Regulation of AP-2-synaptotagmin interaction by inositol high polyphosphates. Biochem. Biophys. Res. Commun. 240, 128-131 [PubMed]

 

（1996年）

 

96-1) Fukuda, M., Kojima, T. and Mikoshiba, K. (1996) Phospholipid composition dependence of Ca2+-dependent phospholipid binding to the C2A domain of synaptotagmin IV. J. Biol. Chem. 271, 8430-8434 [PubMed]

 

96-2) Fukuda, M. and Mikoshiba, K. (1996) Structure-function relationships of the mouse Gap1m: Determination of the inositol 1,3,4,5-tetrakisphosphate-binding domain. J. Biol. Chem. 271, 18838-18842 [PubMed] （新規のIP4結合蛋白質としてRab-GAP1mを同定！）

 

96-3) Kojima, T., Fukuda, M., Aruga, J. and Mikoshiba, K. (1996) Calcium-dependent phospholipid binding to the C2A domain of a ubiquitous form of double C2 protein (Doc2β). J. Biochem. 120, 671-676 [PubMed]

 

96-4) Fukuda, M., Kojima, T., Kabayama, H. and Mikoshiba, K. (1996) Mutation of the pleckstrin homology domain of Bruton's tyrosine kinase in immunodeficiency impaired inositol 1,3,4,5-tetrakisphosphate binding capacity. J. Biol. Chem. 271, 30303-30306 [PubMed] （新規のIP4結合蛋白質としてブルトンチロシンキナーゼを同定！）

 

（1995年）

 

95-1) Fukuda, M., Kojima, T., Aruga, J., Niinobe, M. and Mikoshiba, K. (1995) Functional diversity of C2 domains of synaptotagmin family: Mutational analysis of inositol high polyphosphate binding domain. J. Biol. Chem. 270, 26523-26527 [PubMed] （思い出の博士論文の一つ！！C2Bドメイン内のポリリジンの配列にIP4が結合することを発見！）

 

95-2) Mikoshiba, K., Fukuda, M., Moreira, J. E., Lewis, F. M. T., Sugimori, M., Niinobe, M. and Llinás, R. (1995) Role of the C2A domain of synaptotagmin in transmitter release as determined by specific antibody injection into the squid giant synapse preterminal. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92, 10703-10707 [PubMed]

 

95-3) Fukuda, M., Moreira, J. E., Lewis, F. M. T., Sugimori, M., Niinobe, M., Mikoshiba, K. and Llinás, R. (1995) Role of the C2B domain of synaptotagmin in vesicular release and recycling as determined by specific antibody injection into the squid giant synapse preterminal. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92, 10708-10712 [PubMed] （思い出の博士論文の一つ！！C2Bドメインのみの機能を阻害する抗体を得るのが大変でした。）

 

（1994年）

 

94-1) Akiyama, K., Fukuda, M., Kobayashi, N., Matsuoka, A. and Shikama, K. (1994) The pH-depededent swinging-out of the distal histidine residue in ferric hemoglobin of a midge larva (Tokunagayusurika akamusi). Biochim. Biophys. Acta 1208, 306-309 [PubMed]

 

94-2) Fukuda, M., Aruga, J., Niinobe, M., Aimoto, S. and Mikoshiba, K. (1994) Inositol-1,3,4,5-tetrakisphosphate binding to C2B domain of IP4BP/synaptotagmin II. J. Biol. Chem. 269, 29206-29211 [PubMed] （思い出の博士論文の一つ！！IP4受容体としてシナプス小胞に存在するシナプトタグミンIIを同定！）

 

94-3) Niinobe, M., Yamaguchi, Y., Fukuda, M. and Mikoshiba, K. (1994) Synaptotagmin is an inositol polyphosphate binding protein: Isolation and characterizaion as an Ins 1,3,4,5-P4 binding protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 205, 1036-1042 [PubMed]

 

94-4) Llinás, R., Sugimori, M., Lang, E. J., Morita, M., Fukuda, M., Niinobe, M. and Mikoshiba, K. (1994) The inositol high-polyphosphate series blocks synaptic transmission by preventing vesicular fusion: A squid giant synapse study. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 12990-12993 [PubMed]

 

94-5) Aruga, J., Yokota, N., Hashimoto, M., Furuichi, T., Fukuda, M. and Mikoshiba, K. (1994) A novel zinc finger protein, zic, is involved in neurogenesis, especially in the cell lineage of cerebellar granule cells. J. Neurochem. 63, 1880-1890 [PubMed]

 

（1993年）

 

93-1) Fukuda, M., Takagi, T. and Shikama, K. (1993) Polymorphic hemoglobin from a midge larva (Tokunagayusurika akamusi) can be divided into two different types. Biochim. Biophys. Acta 1157, 185-191 [PubMed] （修士論文！釣り餌で知られているアカムシのヘモグロビンの研究です。）

 

 

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