| 高校名 | 選手名 | 守備 | 入団先 | |
|---|---|---|---|---|
| 優勝 | 横浜 | 松坂大輔 | 投手 | 西武 |
| 後藤武敏 | 内野手 | 西武 | ||
| 小池正晃 | 外野手 | 横浜 | ||
| 準優勝 | - | - | - | - |
| ベスト4 | PL学園 | 田中一徳 | 外野手 | 横浜 |
| 大西宏明 | 外野手 | 近鉄 | ||
| 日大藤沢 | 館山昌平 | 投手 | ヤクルト | |
| ベスト8 | 明徳義塾 | 高橋一正 | 投手 | ヤクルト |
| 寺本四郎 | 投手 | ロッテ | ||
| 高鍋 | 矢野修平 | 投手 | 広島 | |
| 3回戦 | 東福岡 | 村田修一 | 投手 | 横浜 |
| 大野隆治 | 捕手 | ダイエー | ||
| 田中賢介 | 内野手 | 日本ハム | ||
| 敦賀気比 | 東出輝裕 | 内野手 | 広島 | |
| 2回戦 | 北照 | 米野智人 | 捕手 | ヤクルト |
| 日本航空 | 松本拓也 | 投手 | 近鉄 | |
| 東筑 | 井生崇光 | 内野手 | 広島 | |
| 1回戦 | 新発田農 | 富樫和大 | 投手 | 日本ハム |
| 加藤健 | 捕手 | 巨人 | ||
| 報徳学園 | 南竜介 | 投手 | 横浜 | |
| 鞘師智也 | 外野手 | 広島 | ||
| 仙台育英 | 真山龍 | 投手 | 西武 | |
| 沖縄水産 | 新垣渚 | 投手 | ダイエー | |
| 稲嶺誉 | 内野手 | ダイエー | ||
| 樟南 | 鶴岡慎也 | 捕手 | 日本ハム | |
| 創価 | 小谷野栄一 | 内野手 | 日本ハム |